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J-GLOBAL ID：202002242340612957   整理番号：20A2508653

枯草菌における胞子形成調節蛋白質(Spo0A)によるDNA認識の原理【JST・京大機械翻訳】

Principle of DNA recognition by sporulation-regulatory protein (Spo0A) in Bacillus subtilis

著者 (4件)： Shukla Saransh (Department of Biosciences and Bioengineering, Indian Institute of Technology Guwahati, Guwahati, Assam, India) ,  Kumar Amit (Department of Biosciences and Bioengineering, Indian Institute of Technology Guwahati, Guwahati, Assam, India) ,  Das Debasish (Department of Biosciences and Bioengineering, Indian Institute of Technology Guwahati, Guwahati, Assam, India) ,  Satpati Priyadarshi (Department of Biosciences and Bioengineering, Indian Institute of Technology Guwahati, Guwahati, Assam, India)
資料名： Journal of Biomolecular Structure and Dynamics  (Journal of Biomolecular Structure and Dynamics)
巻： 38  号： 17  ページ： 5186-5194  発行年： 2020年 
JST資料番号： W5935A  ISSN： 0739-1102  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： マスター胞子形成調節蛋白質Spo0Aは同族DNA配列5′-TGTCGAA-3′(0A-box)に結合し,胞子形成Bacilliにおける数百の遺伝子の転写を制御する。従って,Spo0Aによる類似近認識0Aボックス配列(単一塩基対による拡散)の識別は正確な転写制御に重要である。Spo0Aによる0Aボックス認識の根底にある熱力学は未知である。同族0A-box DNA配列との複合体におけるBacillus subtilis由来のSpo0Aの最近のX線構造は,転写活性化に関連する複雑な原子相互作用ネットワークを明らかにしただけでなく,Spo0Aによる0Aボックス選択性のエネルギーを直接計算する機会を提供した。鋳型としての同族Spo0A-DNA複合体のX線構造を用いて,Spo0Aの相対結合自由エネルギーを,B.subtilisの同族および近認識0A-box配列に定量的に推定した計算機シミュレーションを報告する。結果は,その近認識類似体に対する同族0A-box配列に対するSpo0A結合選好の強さが,0A-box配列におけるミスマッチ(5π→3′)の位置に沿って劇的に変化することを示した。同族配列に有利なSpo0A選択性は,蛋白質-DNA主要溝相互作用の消失と,認識に近いSpo0A-DNA複合体における疎水性ポケットの溶媒曝露によって保証される。計算は,同族と近認識の0Aボックス配列間のSpo0A識別のエネルギーと,B.subtilisにおける転写開始の忠実度を確実にする3D構造へのその関連に関する手がかりを提供する。Ramaswamy H.Sarmaによって共用した。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 自由エネルギー ,  相互作用 ,  計算機シミュレーション ,  ネットワーク ,  疎水性 ,  *DNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  *タンパク質 ,  *胞子形成 ,  複合体 ,  *枯草菌 ,  三次元
準シソーラス用語： DNA配列 ,  転写調節 ,  *DNA認識 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Spo0A ,  0Aボックス ,  転写 ,  分子動力学 ,  自由エネルギー

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  微生物の生化学  (EG03020N)

タイトルに関連する用語 (5件)： 枯草菌 ,  胞子形成 ,  調節蛋白質 ,  DNA認識 ,  原理