海洋酸性化は東部カキ(Crassostrea virginica)のマントル組織における遺伝子発現とDNAメチル化の微妙なシフトを誘導する【JST・京大機械翻訳】

Downey-Wall Alan M.; Cameron Louise P.; Ford Brett M.; McNally Elise M.; Venkataraman Yaamini R.; Roberts Steven B.; Ries Justin B.; Lotterhos Katie E.

文献

J-GLOBAL ID：202002243320778986 整理番号：20A2697729

海洋酸性化は東部カキ(Crassostrea virginica)のマントル組織における遺伝子発現とDNAメチル化の微妙なシフトを誘導する【JST・京大機械翻訳】

Ocean Acidification Induces Subtle Shifts in Gene Expression and DNA Methylation in Mantle Tissue of the Eastern Oyster (Crassostrea virginica)

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資料名：
巻： 7 ページ： 566419 発行年： 2020年
JST資料番号： U7076A ISSN： 2296-7745 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：スイス (CHE) 言語：英語 (EN)

初期証拠は,DNAメチル化が海洋石灰化種の海洋酸性化(OA)に対する表現型応答を仲介することを示唆する。しかし,時間を通して石灰化組織におけるDNAメチル化を明示的に研究した研究は少ない。ここでは,80日間にわたって実験的OAに曝露した成体東部カキ(Crassostrea virginica)の外alli液とマントル(石灰化部位での流体と組織)における表現型と分子応答を調べた。カキを3つの実験的pCO_2処理(対照,”580μatm;”中等度OA”,1000μatm;”高OA”,2800μatm)下で飼育し,6時点(24h-80日)でサンプリングした。高OAは,第9日でピークに達する外部海水と比較して,外洋液(pH_EPF)のpHの増加を初期に誘導するが,その後時間とともに減少することを見出した。石灰化率は他の処理と比較して高OA処理で有意に低かった。カキがそれらの外洋性流体をどのように調節するかを調べるために,遺伝子発現およびDNAメチル化を,対照および高OA処理において,9日目および80日目からカキのマントル端組織で検査した。マントル組織は,時間を通してシフトしたOAに対して,有意な全体的分子応答(トランスクリプトームとメチロームの両方)を搭載した。OA下で有意に差次的に発現した個々の遺伝子は見られなかったが,pH_EPFはいくつかの共発現遺伝子クラスターの固有遺伝子発現と有意に相関した。少数のOA誘導特異的メチル化遺伝子座を発見し,これはゲノムワイド遺伝子体DNAメチル化と遺伝子発現におけるOA誘導変化間の弱い関連と一致した。しかし,遺伝子体メチル化は,pH_EPF相関遺伝子クラスターの固有遺伝子発現と有意に相関しなかった。これらの結果から,OAはC.virginicaにおける多数の遺伝子において微妙な応答を誘導するが,分子レベルでの可塑性は限られていることを示唆した。本研究は,海洋石灰化における組織特異的分子応答の理解と,OAに対する生理学的および生物無機化応答の仲介におけるDNAメチル化および遺伝子発現の役割を再評価する必要性を強調する。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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動物に対する影響 , 水圏・生物圏の地球化学

引用文献 (119件)：

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