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J-GLOBAL ID：202002244646282591   整理番号：20A1863986

多体分子動力学における動的n-Tuple計算の加速【JST・京大機械翻訳】

Acceleration of Dynamic n-Tuple Computations in Many-Body Molecular Dynamics

著者 (7件)： Small Patrick E. (Collaboratory for Advanced Computing and Simulations, Dept. of Computer Science, University of Southern California, U.S.A) ,  Liu Kuang (Collaboratory for Advanced Computing and Simulations, Dept. of Computer Science, University of Southern California, U.S.A) ,  Tiwari Subodh (Collaboratory for Advanced Computing and Simulations, Dept. of Computer Science, University of Southern California, U.S.A) ,  Kalia Rajiv K. (Collaboratory for Advanced Computing and Simulations, Dept. of Computer Science, Dept. of Physics & Astronomy, Dept. of Chemical Engineering & Materials Science, University of Southern California, U.S.A) ,  Nakano Aiichiro (Collaboratory for Advanced Computing and Simulations, Dept. of Computer Science, Dept. of Physics & Astronomy, Dept. of Chemical Engineering & Materials Science, Dept. of Biological Sciences, University of Southern California, U.S.A) ,  Nomura Ken-ichi (Collaboratory for Advanced Computing and Simulations, Dept. of Materials Science, University of Southern California, U.S.A) ,  Vashishta Priya (Collaboratory for Advanced Computing and Simulations, Dept. of Computer Science, Dept. of Physics & Astronomy, Dept. of Chemical Engineering & Materials Science, University of Southern California, U.S.A)
資料名： ACM Proceedings  (ACM Proceedings)
号： HPC Asia 2018  ページ： 159-170  発行年： 2018年 
JST資料番号： D0698C  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 粒子の動的n-タプルの計算は,多体分子動力学(MD)シミュレーションにおける原型応用とともに,科学計算において遍在している。n-タプルのダイナミックに生成されたリストに従って計算を再順序付けするタプル分解(TD)アプローチを提案した。対(n=2)と三重項(n=3)相互作用を含むMDシミュレーションのための一般的目的グラフィックス処理ユニットに関するTDアプローチの性能特性を分析した。結果は,従来の粒子分解(PD)アプローチよりもTDアプローチの優れた性能を示した。詳細な解析は,性能を決定する主要因子としてレジスタフットプリントを明らかにした。さらに,TD法は,反応性力場(ReaxFF)法に基づく第一原理形成反応MDシミュレーションにおける四重項(n=4)相互作用のより集中的な計算に対してPDより優れていることが分かった。したがって,本研究は,広範囲の応用にわたってTDアプローチの実行可能な性能ポートビリティを実証する。Please refer to this article’s citation page on the publisher website for specific rights information. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： シミュレーション ,  相互作用 ,  計算機シミュレーション ,  レジスタ ,  力の場 ,  *分子動力学 ,  四重項 ,  第一原理
準シソーラス用語： TD法 ,  分子動力学シミュレーション ,  科学計算 ,  GPU【プロセッサ】 ,  計算材料科学 ,  ReaxFF , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： 応用/計算材料科学と工学 ,  性能測定/解析 ,  モデリングまたはシミュレーション方法

分類 (3件)： 計算機シミュレーション  (JE11000H) ,  数値計算  (JE02000J) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (3件)： 分子動力学 ,  計算 ,  加速