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J-GLOBAL ID：202002244706393866   整理番号：20A2456240

オリエンタルメロン(Cucumis melo L.var.makuwa)における遺伝子型決定に基づくゲノムワイド関連(GWAS)分析による性発現のためのSNPマーカーアッセイと候補遺伝子同定【JST・京大機械翻訳】

SNP marker assay and candidate gene identification for sex expression via genotyping-by-sequencing-based genome-wide associations (GWAS) analyses in Oriental melon (Cucumis melo L.var.makuwa)

著者 (9件)： Kishor D.S. (Department of Life Sciences, College of Life Sciences & Biotechnology, Dongguk University, Gyeonggi-do10326, Republic of Korea) ,  Noh Yoonji (Department of Life Sciences, College of Life Sciences & Biotechnology, Dongguk University, Gyeonggi-do10326, Republic of Korea) ,  Song Woon-Ho (Department of Life Sciences, College of Life Sciences & Biotechnology, Dongguk University, Gyeonggi-do10326, Republic of Korea) ,  Lee Gung Pyo (Department of Plant Science and Technology, Chung-Ang University, Ansung 17546, Republic of Korea) ,  Park Younghoon (Department of Horticultural Bioscience, Miryang 50463, Republic of Korea) ,  Jung Jin-Kee (Seed Testing and Research Center, Korea Seed & Variety Service, Gimcheon 39660, Republic of Korea) ,  Shim Eun-Jo (Seed Testing and Research Center, Korea Seed & Variety Service, Gimcheon 39660, Republic of Korea) ,  Sim Sung-Chur (Department of Bio-resources Engineering, Plant Engineering Research Institute, Sejong University, Seoul, 05006, Republic of Korea) ,  Chung Sang-Min (Department of Life Sciences, College of Life Sciences & Biotechnology, Dongguk University, Gyeonggi-do10326, Republic of Korea)
資料名： Scientia Horticulturae  (Scientia Horticulturae)
巻： 276  ページ： Null  発行年： 2021年 
JST資料番号： W1940A  ISSN： 0304-4238  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： オリエンタルメロンは,東アジアを横断して重要な deしい果実作物である。単一ヌクレオチド多型(SNP)は,遺伝的多様性を検出し,増殖権利を保護するための有用な遺伝子型決定ツールであると考えられている。本研究は,5640のろ過されたSNPを生成するために,48の市販オリエンタルメロン品種を分析することによって,ゲノムワイドSNPを検出するために,遺伝子タイピング(GBS)を使用した。高多型情報量(PIC),遺伝的および物理的距離に基づいて,192のSNPのサブセットを,Fluidigm JunoTMシステムによる検証のための推定SNPとして選択した。これらのうち,164のSNPが87のOrientalメロン品種で検証され,検証率は85.41%であった。さらに,これらの87のオリエンタルメロン品種を164のSNPマーカーに基づいて10の異なるグループに分類した。したがって,ここで検出したSNPマーカーのこれらの大きなセットは,オリエンタルメロンにおける遺伝的多様性研究,品種同定およびマーカー支援選択(MAS)のようないくつかの応用を有する。ゲノムワイド関連(GWAS)分析は,染色体1および8上の性発現に対する2つの新規SNPsを含む,種々の形態学的形質と関連する有意な18のSNPを検出し,これは以前の研究と共局在しなかった。MELO3C015898,MELO3C015904,MELO3C024563,およびMELO3C024565のような4つの潜在的候補遺伝子を,東洋メロンの性発現のためのGWAS-SNP領域内で予測した。したがって,これらの候補遺伝子の同定は,オリエンタルメロンにおける性発現形質の分子遺伝学的機構を研究するための基礎を提供する。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 農作物 ,  *遺伝 ,  *遺伝子型 ,  表現型 ,  *メロン ,  品種 ,  果実【器官】 ,  一塩基多型 ,  *ゲノムワイド関連解析
準シソーラス用語： 染色体1 ,  分子遺伝学 ,  *候補遺伝子 ,  *遺伝子タイピング ,  *遺伝子同定 ,  *SNPマーカー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 東洋メロン ,  表現型 ,  SNPマーカー ,  遺伝子型別 ,  GWAS-SNP

分類 (3件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  果樹  (FC03042G) ,  集団遺伝学  (EC01040J)

タイトルに関連する用語 (11件)： メロン ,  Cucumis ,  遺伝子型決定 ,  ゲノム ,  GWAS ,  分析 ,  性 ,  発現 ,  SNPマーカー ,  アッセイ ,  遺伝子同定