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J-GLOBAL ID:202002245470475876   整理番号:20A2373978

膵臓癌の病理学的診断のための定性的転写シグネチャー【JST・京大機械翻訳】

Qualitative Transcriptional Signature for the Pathological Diagnosis of Pancreatic Cancer
著者 (11件):
資料名:
巻:ページ: 569842  発行年: 2020年 
JST資料番号: U7081A  ISSN: 2296-889X  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: スイス (CHE)  言語: 英語 (EN)
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現在,生検標本を用いて膵癌(PC)を診断するのは,サンプルが不正確な部位から,または不十分な量の組織を含むので,現在,病理学者にとって難しい。したがって,PCから良性膵臓病変を正確に識別するプラットフォーム非依存性分子分類器を開発する必要がある。ここでは,非PC膵炎および健康な膵臓組織からPC組織と癌隣接正常組織の両方を識別するため,遺伝子の試料内相対発現配列(REO)に基づく頑健な定性的メッセンジャーRNAシグネチャを開発した。12の遺伝子対と17の遺伝子からなるシグネチャを訓練データセットで構築し,生検試料と外科的に切除した試料からマイクロアレイとRNA配列決定データセットで検証した。9つのデータベースからの1,007のPC組織と257の非腫瘍サンプルの分析は,感度と特異性の幾何平均が96.7%であり,受信者動作特性曲線下面積が0.978(95%信頼区間,0.947~0.994)であることを示した。内視鏡生検から得られた20の標本に対して,署名は100%の診断精度を有した。ここで述べたREOベースの署名は,PCの分子診断を助け,良性と悪性膵臓病変の間の客観的分化を促進する可能性がある。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (1件):
分類
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消化器の腫よう 
引用文献 (30件):
  • Aksoy-AltinbogaA.BaglanT.UmudumH.CeyhanK. (2018). Diagnostic value of S100p, IMP3, Maspin, and pVHL in the differantial diagnosis of pancreatic ductal adenocarcinoma and normal/chronic pancreatitis in fine needle aspiration biopsy. J. Cytol. 35 247-251. doi: 10.4103/joc.Joc_18_17
  • AoL.ZhangZ.GuanQ.GuoY.GuoY.ZhangJ. (2018). A qualitative signature for early diagnosis of hepatocellular carcinoma based on relative expression orderings. Liver Int. 38 1812-1819. doi: 10.1111/liv.13864 29682909
  • AranD.CamardaR.OdegaardJ.PaikH.OskotskyB.KringsG. (2017). Comprehensive analysis of normal adjacent to tumor transcriptomes. Nat. Commun. 8 1077-1077. doi: 10.1038/s41467-017-01027-z 29057876
  • BanafeaO.MghangaF. P.ZhaoJ.ZhaoR.ZhuL. (2016). Endoscopic ultrasonography with fine-needle aspiration for histological diagnosis of solid pancreatic masses: a meta-analysis of diagnostic accuracy studies. BMC Gastroenterol. 16:108. doi: 10.1186/s12876-016-0519-z 27580856
  • ChenR.GuanQ.ChengJ.HeJ.LiuH.CaiH. (2017). Robust transcriptional tumor signatures applicable to both formalin-fixed paraffin-embedded and fresh-frozen samples. Oncotarget 8 6652-6662. doi: 10.18632/oncotarget.14257 28036264
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