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J-GLOBAL ID：202002246054071231   整理番号：20A1202482

DNAポリメラーゼとDNA二本鎖へのBP[dG]誘導歪:複製を阻止するBP付加物の詳細な機構【JST・京大機械翻訳】

BP[dG]-induced distortions to DNA polymerase and DNA duplex: A detailed mechanism of BP adducts blocking replication

著者 (13件)： Wu Zhixiang (College of Pharmacy and Biological Engineering, Sichuan Industrial Institute of Antibiotics, Key Laboratory of Coarse Cereal Processing, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Chengdu University, Chengdu, China) ,  Peng Lianxin (College of Pharmacy and Biological Engineering, Sichuan Industrial Institute of Antibiotics, Key Laboratory of Coarse Cereal Processing, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Chengdu University, Chengdu, China) ,  Hu Yichen (College of Pharmacy and Biological Engineering, Sichuan Industrial Institute of Antibiotics, Key Laboratory of Coarse Cereal Processing, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Chengdu University, Chengdu, China) ,  Xie Tao (College of Pharmacy and Biological Engineering, Sichuan Industrial Institute of Antibiotics, Key Laboratory of Coarse Cereal Processing, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Chengdu University, Chengdu, China) ,  Yan Hailian (College of Pharmacy and Biological Engineering, Sichuan Industrial Institute of Antibiotics, Key Laboratory of Coarse Cereal Processing, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Chengdu University, Chengdu, China) ,  Wan Hua (College of Mathematics and Informatics, South China Agricultural University, Guangzhou, China) ,  Liu Wei (College of Pharmacy and Biological Engineering, Sichuan Industrial Institute of Antibiotics, Key Laboratory of Coarse Cereal Processing, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Chengdu University, Chengdu, China) ,  Liang Li (College of Pharmacy and Biological Engineering, Sichuan Industrial Institute of Antibiotics, Key Laboratory of Coarse Cereal Processing, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Chengdu University, Chengdu, China) ,  Xie Zhenjian (College of Pharmacy and Biological Engineering, Sichuan Industrial Institute of Antibiotics, Key Laboratory of Coarse Cereal Processing, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Chengdu University, Chengdu, China) ,  Liu Kunping (College of Pharmacy and Biological Engineering, Sichuan Industrial Institute of Antibiotics, Key Laboratory of Coarse Cereal Processing, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Chengdu University, Chengdu, China) ,  Shi Hubing (Laboratory of Tumor Targeted and Immune Therapy, Clinical Research Center for Breast, State Key Laboratory of Biotherapy, West China Hospital, Sichuan University and Collaborative Innovation Center, Chengdu, China) ,  Zhao Gang (College of Pharmacy and Biological Engineering, Sichuan Industrial Institute of Antibiotics, Key Laboratory of Coarse Cereal Processing, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Chengdu University, Chengdu, China) ,  Hu Jianping (College of Pharmacy and Biological Engineering, Sichuan Industrial Institute of Antibiotics, Key Laboratory of Coarse Cereal Processing, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Chengdu University, Chengdu, China)
資料名： Food and Chemical Toxicology  (Food and Chemical Toxicology)
巻： 140  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： B0937A  ISSN： 0278-6915  CODEN： FCTOD7  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 最も広範な環境汚染物質の一つとして,ベンゾ[α]ピレンはジオールエポキシドに代謝され,その後,多くのヒト癌の発生と発生に密接に関連する最初のDNA塩基対を共有結合的に破壊する。高忠実度DNAポリメラーゼは核酸複製の信頼性または忠実度の維持において非常に重要な役割を果たし,それは一般的にBP付加物によってブロックされる。BPのブロッキング機構を明らかにするために,正常およびBP結合DNA二本鎖を有する好熱性Bacillus stearothermophilus DNAポリメラーゼI大フラグメント(BF)複合体について2つの比較分子動力学シミュレーションを行った。全体的立体配座変化と分子相互作用の結果は,BPの会合が分子内水素結合の再配列をもたらし,ポリメラーゼとDNA二本鎖の間の分子認識を損なうことを示した。DNA二本鎖の立体配座は分子全体の剛性の増加を伴って歪んでいることも分かった。可能性のあるブロッキング機構の観点から,BP部分は特別な垂直立体配座において塩基対環境に完全に統合され,入力ヌクレオチドに必要な空間を占める。本研究は,原子レベルでのDNA複製に及ぼすBPの毒性効果を理解するための有用な動力学と構造情報を提供する。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 分子間相互作用 ,  立体配座 ,  配座転移 ,  *DNA【核酸】 ,  *DNAポリメラーゼ ,  ヌクレオチド ,  ヒト ,  複合体 ,  ブロッキング ,  DNA複製 ,  Bacillus stearothermophilus ,  共有結合 ,  分子認識 ,  ジオール
準シソーラス用語： 分子動力学シミュレーション , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： ベンゾ[α]ピレン ,  DNAポリメラーゼ ,  分子動力学シミュレーション ,  毒性 ,  リスク管理

分類 (5件)： 発癌機序・因子  (GE02020C) ,  有機化合物の毒性  (GZ02030Y) ,  酵素製剤・酵素阻害剤の基礎研究  (GW21010W) ,  動物に対する影響  (EE05040R) ,  食品衛生一般  (FJ01051H)

タイトルに関連する用語 (9件)： DNAポリメラーゼ ,  DNA ,  BP ,  dG ,  誘導 ,  歪 ,  複製 ,  阻止 ,  付加物