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J-GLOBAL ID：202002247133204302   整理番号：20A1463453

スギの施肥による遺伝子発現応答メカニズムのトランスクリプトーム解析【JST・京大機械翻訳】

A transcriptome analysis of the gene expression responses induced by fertilization treatments in Chinese ifr

著者 (6件)： Qi Ming (中国林業科学研究院亜熱帯林業研究所,浙江富陽,311400) ,  He Guiping (中国林業科学研究院亜熱帯林業研究所,浙江富陽,311400) ,  Wang Hairong (浙江省遂昌県林業技術推广総站,浙江遂昌,323300) ,  Qiu Yongbin (浙江省開化県林場,浙江開化,324300) ,  Cheng Yaping (浙江省慶元県慶元林場,浙江慶元,323805) ,  Xu Zhaoyou (浙江省竜泉市林科院,浙江竜泉,323700)
資料名： Zhongnan Linye Keji Daxue Xuebao  (Zhongnan Linye Keji Daxue Xuebao)
巻： 40  号： 4  ページ： 101-110  発行年： 2020年 
JST資料番号： C2295A  ISSN： 1673-923X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： [目的]遺伝子発現レベルから、施肥によるコウヨウザンの遺伝子発現の変化法則を研究し、コウヨウザンの施肥理論とMAS育種の実践に科学的な根拠を提供した。[方法]1年生のコウヨウザン無性系開6の挿し木を研究対象とし、4種類の施肥処理を行い、3つの反復を処理し、IlluminaHiSeq4000のハイスループットシークエンシング技術を用いてシークエンシングを行い、シークエンシング結果に対して無参トランスクリプトーム分析を行った。【結果】1)トランスクリプトームシークエンシングは,cleanreads5.0E+07ntから7.1E+07ntまで,総スプライシング長さは724341090ntであり,Trinityによって組み立てられた。74288個のunigenes(遺伝子)が得られ、その後、組み立て序列を6つのデータベース(Nr、Swiss-prot、eggNOG、KEGG、Pfam、GO)にBLASTX分析を行い、機能アノテーション情報を獲得した。2)異なる施肥処理に対する遺伝子応答の応答は,Wen図によって明らかにされた。-P-N1-VS-WT比較グループでは、無施肥処理、4650個の特異的発現遺伝子があり、その中にいくつかの耐性遺伝子が含まれ、その他の比較グループも相応の結果を得た。コウヨウザンの施肥はいくつかの遺伝子の開放とアップレギュレーションを誘導し、同時にいくつかの遺伝子発現の閉鎖或いはダウンレギュレーションを引き起こす。異なる処理間の発現差異遺伝子数は、異なる施肥群の間で大きく変化し、有意な差発現遺伝子はリン施用と対照比較群の429個からリン施用と窒素施肥比較群の4942であった。3)異なる処理間の遺伝子発現は,異なる処理間の遺伝子発現と相補的関係を示した。同一遺伝子は高発現し,低発現であった。4)GOの濃縮と分類は、施肥がコウヨウザンに著しく影響する遺伝子が主に葉緑体に定位していることを示した。細胞骨格?細胞膜?細胞核?5)GOの濃縮分析の結果,窒素(リン)肥料は窒素(リン)の吸収と代謝を促進するだけでなく,リン(窒素)の吸収と代謝も促進し,6)リン肥料とアミノアシル-tRNAの高分子化合物合成の生理学的および生化学的過程を分析した。以上の研究結果に基づき、今後、トランスクリプトーム分析で得られた重要な遺伝子について研究を行うことができ、その結果はコウヨウザンの施肥とコウヨウザンの栄養遺伝育種MASの選択を指導するために用いることができる。[結論]RNA-seqハイスループットシークエンシング技術は、非モデル植物(ゲノム比が大きい針葉樹を含む)の施肥分子メカニズムを研究するのに、迅速で簡便な方法である。研究の結果,施肥はN?Pの吸収?遺伝子輸送と利用に関連する遺伝子発現は,成長と光合成に関連する遺伝子発現を下方制御した。施肥はコウヨウザンの成長と発育を適応させる。競争資源と成長の方向が発展した。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  *施肥 ,  *遺伝子 ,  葉緑体 ,  光合成 ,  細胞核 ,  細胞膜 ,  育種 ,  *遺伝子発現 ,  ダウンレギュレーション ,  アップレギュレーション ,  アノテーション ,  *トランスクリプトーム
準シソーラス用語： 配列解析 ,  *トランスクリプトーム解析 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 森林植物学  (FF02020E) ,  施肥法・肥効  (FB05030Y)

タイトルに関連する用語 (6件)： スギ ,  施肥 ,  遺伝子発現 ,  応答 ,  メカニズム ,  トランスクリプトーム解析