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J-GLOBAL ID：202002247207481917   整理番号：20A0493660

蛋白質-蛋白質相互作用ネットワークと遺伝子機能情報により正則化された非負マトリックス因子分解による蛋白質機能の予測【JST・京大機械翻訳】

Predicting protein functions through non-negative matrix factorization regularized by protein-protein interaction network and gene functional information

著者 (5件)： Peng Wei (Kunming University of Science and Technology, Computer Technology Application Key Lab of Yunnan Province, Kunming University of Science and Technology,Faculty of Information Engineering and Automation,Kunming,China) ,  Li Lun (Kunming University of Science and Technology, Computer Technology Application Key Lab of Yunnan Province, Kunming University of Science and Technology,Faculty of Information Engineering and Automation,Kunming,China) ,  Dai Wei (Kunming University of Science and Technology, Computer Technology Application Key Lab of Yunnan Province, Kunming University of Science and Technology,Faculty of Information Engineering and Automation,Kunming,China) ,  Du Jielin (Kunming University of Science and Technology, Computer Technology Application Key Lab of Yunnan Province, Kunming University of Science and Technology,Faculty of Information Engineering and Automation,Kunming,China) ,  Lan Wei (School of Computer, Electronic and Information, Guangxi University, Guangxi University,Nanning,China)
資料名： IEEE Conference Proceedings  (IEEE Conference Proceedings)
巻： 2019  号： BIBM  ページ： 86-89  発行年： 2019年 
JST資料番号： W2441A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 蛋白質機能予測は生命を理解するために必要であり,薬物設計と健康管理への応用に価値がある。多生物学的情報を統合することにより,蛋白質機能を正確に予測することは依然として大きな課題である。本研究では,蛋白質機能予測のために,PPIネットワークとGO類似性ネットワーク,すなわちPONMFによって正則化された新しい非負行列因数分解(NMF)ベースの方法を提案した。これは既知のGO蛋白質会合マトリックスを蛋白質とGO項のための2つの低ランクマトリックスに分解する。因数分解の過程で,PONMFはラベル行列因数分解項,付加的ネットワーク正則化項,およびGO類似性正則化項を目的関数に組み込んだ。最後に,2つの低ランクマトリックスの生成物を参照することにより,潜在的蛋白質機能を予測した。PONMFは,蛋白質機能を予測するために多様な生物学的情報を成功裏に統合するだけでなく,異なるモジュールに蛋白質を自然に分割し,同じモジュールにおいて蛋白質から機能する。著者らの方法と他の2つの最先端法(UBiRWとNMFGO)は,S.cerevisiaeとH.sapiensの蛋白質に対する機能を予測するために適用される。予測結果は,PONMFが他の2つの既存の方法より優れていることを示した。Copyright 2020 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *正則化 ,  類似性 ,  ドラッグデザイン ,  *タンパク質 ,  因数分解 ,  *ネットワーク ,  健康管理 ,  目的関数
準シソーラス用語： 行列因数分解 ,  非負行列因子分解 ,  *蛋白質機能 ,  *因子分解 ,  *遺伝子機能 ,  蛋白質間相互作用 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 図形・画像処理一般  (JE04010I)

タイトルに関連する用語 (7件)： 蛋白質-蛋白質相互作用 ,  遺伝子機能 ,  正則化 ,  マトリックス ,  因子分解 ,  蛋白質機能 ,  予測