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J-GLOBAL ID：202002247952408042   整理番号：20A0019124

超並列配列決定を用いた高地チベット民族性の全ミトコンドリアゲノム解析【JST・京大機械翻訳】

Whole mitochondrial genome analysis of highland Tibetan ethnicity using massively parallel sequencing

著者 (9件)： Wang Mengge (Institute of Forensic Medicine, West China School of Basic Science & Forensic Medicine, Sichuan University, Chengdu, 610041, China) ,  Wang Zheng (Institute of Forensic Medicine, West China School of Basic Science & Forensic Medicine, Sichuan University, Chengdu, 610041, China) ,  He Guanglin (Institute of Forensic Medicine, West China School of Basic Science & Forensic Medicine, Sichuan University, Chengdu, 610041, China) ,  Wang Shouyu (Institute of Forensic Medicine, West China School of Basic Science & Forensic Medicine, Sichuan University, Chengdu, 610041, China) ,  Zou Xing (Institute of Forensic Medicine, West China School of Basic Science & Forensic Medicine, Sichuan University, Chengdu, 610041, China) ,  Liu Jing (Institute of Forensic Medicine, West China School of Basic Science & Forensic Medicine, Sichuan University, Chengdu, 610041, China) ,  Wang Fei (Institute of Forensic Medicine, West China School of Basic Science & Forensic Medicine, Sichuan University, Chengdu, 610041, China) ,  Ye Ziwei (Institute of Forensic Medicine, West China School of Basic Science & Forensic Medicine, Sichuan University, Chengdu, 610041, China) ,  Hou Yiping (Institute of Forensic Medicine, West China School of Basic Science & Forensic Medicine, Sichuan University, Chengdu, 610041, China)
資料名： Forensic Science International: Genetics  (Forensic Science International: Genetics)
巻： 44  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： W3148A  ISSN： 1872-4973  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ミトコンドリアDNA(mtDNA)は多数の多面的で複雑な生物学的過程における重要なプレイヤーであり,その母性遺伝的性質と比較的高い突然変異率により,異なる個体群のpeoplingの分析において重要な役割を果たす。本研究において,中国のマルチチベット自治区(3,000m以上の平均高度)からの119のチベット人を,イオンS5XLシステム上の精密ID mtDNA W正孔 Genome Panelを用いた超並列配列決定(MPS)技術により,ミトコンドリアゲノム(ミトゲノム)配列決定に用いた。データセットは88の異なるハプロタイプを示し,0.9909のハプロタイプ多様性をもたらした。ハプロタイプの大部分は東アジア系統に割り当てられ,マルチチベットのハプログループの分布は参照チベット個体群と有意に異なった。119個の新たに発生したミトゲノムにより再構成された最大節約系統発生は,12の主要なマルチチベット系統を明らかにした。興味深いことに,4216と15924での突然変異の欠如を伴うShepa特異的サブハプログループA15c1は,著者らのデータセットで識別され,Sherpasの母性遺伝子プールがチベットの個体群から由来する可能性があることを示唆した。マルチチベットと低地漢民族の間の共有されたハプログループは,これらの系統がチベット高原におけるそれらの到着の前に,非チベット人から由来し,すでに分化している可能性があることを暗示した。さらに,広範なペアワイズ個体群比較により,マルチチベットは民族的または言語学的に近いNyingtriチベット,Nyingtri LhobaおよびChamdoチベット個体群とより密接な遺伝的関係を有することを示した。また,遺伝的親和性は,Muliチベットと北部Han中国の間で観察された。まとめると,本研究で得られた結果は,既存の方法論的mtDNAデータベースを豊かにし,法医学的研究における全ミトゲノム配列決定の応用におけるさらなる興味を高めた。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *高地 ,  言語学 ,  *ミトコンドリア ,  個体群 ,  親和性 ,  *チベット自治区 ,  法医学 ,  突然変異 ,  *ゲノム ,  ハプロタイプ ,  データベース ,  遺伝 ,  *超並列処理 ,  系統発生 ,  低地

著者キーワード (6件)： 法医学 ,  ミトゲノム ,  ミトコンドリアのハプロタイプ ,  超並列シークエンシング ,  系統発生解析 ,  チベット

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (5件)： 高地 ,  チベット ,  民族性 ,  ミトコンドリア ,  ゲノム解析