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J-GLOBAL ID：202002248203941382   整理番号：20A2645342

エチオピアのモロコシ生殖質の包括的表現型およびゲノム特性評価はコアコレクションを定義し,適応形質における豊富な遺伝的可能性を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

A comprehensive phenotypic and genomic characterization of Ethiopian sorghum germplasm defines core collection and reveals rich genetic potential in adaptive traits

著者 (16件)： Girma Gezahegn (Department of Botany and Plant Pathology, Purdue University, West Lafayette, IN, 47907, USA) ,  Nida Habte (Department of Botany and Plant Pathology, Purdue University, West Lafayette, IN, 47907, USA) ,  Tirfessa Alemu (Ethiopian Institute of Agricultural Research, P.O. Box 2003, Addis Ababa, Ethiopia) ,  Lule Dagnachew (Oromia Agricultural Research Institute, P.O. Box 81265, Addis Ababa, Ethiopia) ,  Bejiga Tamirat (Ethiopian Institute of Agricultural Research, P.O. Box 2003, Addis Ababa, Ethiopia) ,  Seyoum Amare (Ethiopian Institute of Agricultural Research, P.O. Box 2003, Addis Ababa, Ethiopia) ,  Mekonen Moges (Ethiopian Institute of Agricultural Research, P.O. Box 2003, Addis Ababa, Ethiopia) ,  Nega Amare (Ethiopian Institute of Agricultural Research, P.O. Box 2003, Addis Ababa, Ethiopia) ,  Dessalegn Kebede (Oromia Agricultural Research Institute, P.O. Box 81265, Addis Ababa, Ethiopia) ,  Birhanu Chemeda (Oromia Agricultural Research Institute, P.O. Box 81265, Addis Ababa, Ethiopia) ,  Bekele Alemnesh (Haramaya University, P.O. Box 138, Dire Dawa, Ethiopia) ,  Gebreyohannes Adane (Ethiopian Institute of Agricultural Research, P.O. Box 2003, Addis Ababa, Ethiopia) ,  Ayana Getachew (Ethiopian Institute of Agricultural Research, P.O. Box 2003, Addis Ababa, Ethiopia) ,  Tesso Tesfaye (Department of Agronomy, Kansas State University, 3007 Throckmorton PSC 1712 Claflin Road, Manhattan, KS, 66506, USA) ,  Ejeta Gebisa (Department of Agronomy, Purdue University, West Lafayette, IN, 47907, USA) ,  Mengiste Tesfaye (Department of Botany and Plant Pathology, Purdue University, West Lafayette, IN, 47907, USA)
資料名： Plant Genome  (Plant Genome)
巻： 13  号： 3  ページ： e20055  発行年： 2020年 
JST資料番号： W5739A  ISSN： 1940-3372  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 作物の個体群の遺伝的構造と多様性を理解することは,植物育種における選択戦略の設計に不可欠である。約2010年のエチオピアモロコシ系統は,複数の場所で異なる形質のために表現型化された。収集のサブセット,1628の系統,主に在来種,いくつかの改良品種,および近交系を配列決定によって遺伝子型を決定した。表現型データは,異なるモロコシ成長農業気候地域,高い遺伝的多様性およびエチオピアモロコシ生殖質における希少自然変動の存在を有する重要な形質の関連性を明らかにした。その後の遺伝子型分析は,各モロコシ系統の亜集団,異なるクラスタ群,および祖先の最適数を決定した。生殖質の利用を改善するために,387系統のコアサブセットを,GBS分析を通して得られたクラスタ群に基づく遺伝子型の事後グループ化に従って選択し,続いて定量的形質を用いて層別無作為抽出を行った。エチオピアからのこの新しいモロコシとキビの技術革新研究室(SMIL)収集が,米国農務省(USDA-NPGS)とモロコシ関連パネル(SAP)における最大世界モロコシ収集の中でどのように表現されるかを評価するために,SNPデータに基づいて比較を実施した。SMILコレクションは,USDA-NPGS生殖質といくつかの冗長性を持つ高い遺伝的多様性を示したが,SAPは明確な差異を示した。さらに,ゲノム-環境関連分析は,異なる環境に対する適応可能性の開発に重要である非生物的因子への適応に関連する候補遺伝子を同定した。要約すると,著者らの結果は,モロコシ収集の多様性と関係,開発したコアの代表性を記述し,非生物的ストレス耐性に関連する候補遺伝子への新しい洞察を提供する。Copyright 2020 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 気候 ,  *遺伝 ,  遺伝子型 ,  *表現型 ,  層別 ,  *ゲノム ,  クラスタ ,  *モロコシ ,  作物育種 ,  個体群 ,  在来種
準シソーラス用語： 候補遺伝子 ,  *生殖質 ,  非生物的ストレス ,  近交系 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 作物の品種改良  (FC02030G) ,  トウモロコシ  (FC03034D) ,  作物育種一般  (FC02010K)

タイトルに関連する用語 (9件)： エチオピア ,  モロコシ ,  生殖質 ,  表現型 ,  ゲノム ,  特性評価 ,  コアコレクション ,  定義 ,  可能性