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J-GLOBAL ID：202002248270742524   整理番号：20A0215151

メチロームとトランスクリプトーム変化の統合分析は中国Zhongweiヤギにおけるcur毛形質転換を駆動する基本的な調節特性を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Integrated Analysis of Methylome and Transcriptome Changes Reveals the Underlying Regulatory Signatures Driving Curly Wool Transformation in Chinese Zhongwei Goats

著者 (11件)： Xiao Ping (1Key Laboratory of Animal (Poultry) Genetics Breeding and Reproduction, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Institute of Animal Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing, China) ,  Xiao Ping (2Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, College of Animal Science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu, China) ,  Zhong Tao (2Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, College of Animal Science and Technology, Sichuan Agricultural University, Chengdu, China) ,  Liu Zhanfa (3The Ningxia Hui Autonomous Region Breeding Ground of Zhongwei Goat, Department of Agriculture and Rural Areas of Ningxia Hui Autonomous Region, Wuzhong, China) ,  Ding Yangyang (1Key Laboratory of Animal (Poultry) Genetics Breeding and Reproduction, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Institute of Animal Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing, China) ,  Guan Weijun (1Key Laboratory of Animal (Poultry) Genetics Breeding and Reproduction, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Institute of Animal Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing, China) ,  He Xiaohong (1Key Laboratory of Animal (Poultry) Genetics Breeding and Reproduction, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Institute of Animal Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing, China) ,  Pu Yabin (1Key Laboratory of Animal (Poultry) Genetics Breeding and Reproduction, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Institute of Animal Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing, China) ,  Jiang Lin (1Key Laboratory of Animal (Poultry) Genetics Breeding and Reproduction, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Institute of Animal Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing, China) ,  Ma Yuehui (1Key Laboratory of Animal (Poultry) Genetics Breeding and Reproduction, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Institute of Animal Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing, China) ,  Zhao Qianjun (1Key Laboratory of Animal (Poultry) Genetics Breeding and Reproduction, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Institute of Animal Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing, China)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 10  ページ： 1263  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Zhongweiヤギは,キッドが約1か月齢であるときに現れる美しい白いcurpelに対して主に保たれている。しかしながら,この代表的表現型は,複数の分子シグナルにより仲介される可能性のある過程における出生後発生の間に,しばしばより少ないカール表現型に変化する。DNAメチル化は哺乳類細胞過程において重要な役割を果たし,毛包(HF)発生の開始に必須である。本研究では,基礎となるカーフリーズ動力学の発現プロファイルを組み合わせることにより,全ゲノムDNAメチル化の影響を調べることを試みた。45~108日齢のヤギから収集した皮膚組織の全ゲノムDNAメチル化マップとトランスクリプトームを,全ゲノム重亜硫酸塩基配列決定(WGB)とRNA配列決定のためにそれぞれ用いた。2つの発生段階の間で,3379の異なるメチル化領域(DMRs)の1,250は,異なるメチル化遺伝子(DMGs)で注釈され,これらの領域は主に細胞間コミュニケーションと細胞骨格に関連していた。メチロームとトランスクリプトームデータの統合解析により,後成的機構を通して羊毛繊維の発生に重要な因子をコードする14の重複遺伝子の同定が可能になった。さらに,ヒト毛髪内根鞘細胞(HHIRSCs)を用いた機能的研究は,重複遺伝子の1つ,血小板由来成長因子C(PDGFC)が細胞移動と増殖を促進するいくつかの重要なHF関連遺伝子のメッセンジャーRNA発現に有意な影響を有することを明らかにした。著者らの研究は,メチオニンマップと転写発現を組み合わせることによって,フリート形態学的変化の謎を調査するために使用された前例のない分析を提示する。そして,これらのデータは,繊維発生に潜在的に影響を及ぼすステージ特異的な後成的変化を明らかにした。さらに,著者らの機能的研究は,HF細胞増殖における重複遺伝子PDGFCに対する可能な役割を強調し,それは毛皮選択のための予測可能なバイオマーカーである可能性がある。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 日齢 ,  ヒト ,  バイオマーカー ,  メチル化 ,  mRNA ,  表現型 ,  エピジェネティクス ,  DNA【核酸】 ,  細胞増殖 ,  毛包 ,  亜硫酸水素塩 ,  遺伝子 ,  ゲノム ,  *トランスクリプトーム ,  毛皮

著者キーワード (6件)： Zhongweiヤギ ,  デオキシリボ核酸メチル化 ,  カーリーフェルト ,  エピジェネティクス ,  トランスクリプトーム ,  血小板由来成長因子C

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (65件)：

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• Alimperti S., Lei P., Tian J., Andreadis S. T. (2012). A novel lentivirus for quantitative assessment of gene knockdown in stem cell differentiation. Gene Ther. 19 (12), 1123-1132. doi: doi: 10.1038/gt.2011.208
• Arita K., Akiyama M., Tsuji Y., McMillan J. R., Eady R. A., Shimizu H. (2004). Gap junction development in the human fetal hair follicle and bulge region. Br. J. Dermatol. 150 (3), 429-434. doi: doi: 10.1046/j.1365-2133.2004.05775.x
• Basmanav FB U., Cau L., Tafazzoli A., Mechin M. C., Wolf S., Romano M. T., et al. (2016). Mutations in three genes encoding proteins involved in hair shaft formation cause uncombable hair syndrome. Am. J. Hum. Genet. 99 (6), 1292-1304. doi: doi: 10.1016/j.ajhg.2016.10.004

タイトルに関連する用語 (8件)： トランスクリプトーム ,  統合 ,  分析 ,  中国 ,  ヤギ ,  毛 ,  形質転換 ,  調節