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J-GLOBAL ID：202002248786617630   整理番号：20A0058515

遺伝子オントロジーと蛋白質相互作用トポロジーの統合により抽出された白斑プロテオームのためのパラメトリック標的性評価アプローチ【JST・京大機械翻訳】

A Parametric Targetability Evaluation Approach for Vitiligo Proteome Extracted through Integration of Gene Ontologies and Protein Interaction Topologies

著者 (4件)： Malhotra Anvita Gupta (Maulana Azad National Institute of Technology, Bhopal, Madhya Pradesh, India) ,  Singh Sudha (Department of Biological Science and Engineering, Maulana Azad National Institute of Technology, Bhopal, Madhya Pradesh, India) ,  Jha Mohit (Department of Biological Science and Engineering, Maulana Azad National Institute of Technology, Bhopal, Madhya Pradesh, India) ,  Pandey Khushhali M. (Department of Biological Science and Engineering, Maulana Azad National Institute of Technology, Bhopal, Madhya Pradesh, India)
資料名： IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics  (IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics)
巻： 16  号： 6  ページ： 1830-1842  発行年： 2019年 
JST資料番号： W1409A  ISSN： 1545-5963  CODEN： ITCBCY  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 白斑は複雑な病因を伴うよく知られた皮膚疾患である。白斑の病因は多くの分岐を伴って多面的である。蛋白質相互作用ネットワークと遺伝子オントロジー用語から特性を融合することによって候補疾患蛋白質を最初に提案するために,計算的全身経路を設計した。全部で109の蛋白質が同定され,疾患の発症またはその進行に関与していることが示唆された。その後,標準標的同定基準に対する特性を比較し,ベンチマーキングすることにより,白斑病蛋白質を優先順位付けするために複合アプローチを採用した。これには,配列に基づく,構造的,機能的,本質的,蛋白質-蛋白質相互作用,脆弱性,分泌性,アッセイ性,および薬剤性情報が含まれている。既存の情報は,疾患蛋白質の標的性の評価のための新しいプロトコルを提案するために,効率的なパイプラインにシームレスに統合された。オンラインデータ資源とスクリプトを用いて,68の潜在的薬物標的の説明リストを白斑のために発生させた。このリストは特定の蛋白質における研究コミュニティの現在の関心と広く一致しているが,さらなる研究に役立つ可能性のある新しい標的候補を示唆し,選択された基準(すなわち定量的アプローチ)の重みを調整するか,または考慮された基準(定性的アプローチ)を変更することにより,それを修正することができる。Copyright 2020 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： コミュニティ ,  *位相幾何学 ,  皮膚病 ,  白板症 ,  ネットワーク ,  病因 ,  *タンパク質 ,  分泌 ,  *プロテオーム
準シソーラス用語： 創薬標的 ,  スクリプト ,  脆弱性 ,  ベンチマーキング ,  *蛋白質間相互作用 ,  *遺伝子オントロジー , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (8件)： 遺伝子オントロジー ,  蛋白質相互作用 ,  トポロジー ,  統合 ,  白斑 ,  プロテオーム ,  標的 ,  評価