文献

J-GLOBAL ID：202002248892004789   整理番号：20A2090866

シークエンシング関連研究における多重形質のための試験遺伝子-環境相互作用【JST・京大機械翻訳】

Test Gene-Environment Interactions for Multiple Traits in Sequencing Association Studies

著者 (8件)： Zhang Jianjun (Department of Mathematics, University of North Texas, Denton, Texas, USA) ,  Sha Qiuying (Department of Mathematical Sciences, Michigan Technological University, Houghton, Michigan, USA) ,  Hao Han (Department of Mathematics, University of North Texas, Denton, Texas, USA) ,  Zhang Shuanglin (Department of Mathematical Sciences, Michigan Technological University, Houghton, Michigan, USA) ,  Gao Xiaoyi Raymond (Department of Ophthalmology and Visual Science, The Ohio State University, Columbus, Ohio, USA) ,  Gao Xiaoyi Raymond (Department of Biomedical Informatics, The Ohio State University, Columbus, Ohio, USA) ,  Gao Xiaoyi Raymond (Division of Human Genetics, The Ohio State University, Columbus, Ohio, USA) ,  Wang Xuexia (Department of Mathematics, University of North Texas, Denton, Texas, USA)
資料名： Human Heredity  (Human Heredity)
巻： 84  号： 4-5  ページ： 170-196  発行年： 2020年 
JST資料番号： E0529B  ISSN： 0001-5652  CODEN： HUHEAS  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 動機:多くの複合疾患のリスクは,遺伝的および環境的因子の相互作用によって決定される。複数の形質に対する遺伝子-環境相互作用(G×Es)の検討は,疾患の病因に関する貴重な洞察をもたらし,疾患関連遺伝子の検出における力を増加させる。しかし,複数の形質のためのG×Esをテストする方法は,非常に限られている。方法:配列決定関連研究における多重形質に対するG×E試験の新規アプローチを開発した。最初に,主成分分析または標準化解析のいずれかを用いて複数の形質の変換を行った。次に,G×E(TOW-GE)および/または可変重量TOW-GE(VW-TOW-GE)の最適加重組合せの効果をテストする,新規提案試験を用いてG×Esの影響を検出した。最後に,p値を結合するためにFisherの組合せ試験を採用した。結果:広範なシミュレーション研究は,提案した方法のI型誤り率が良好に制御されることを示した。相互作用配列カーネル会合試験(ISKAT)と比較して,TOW-GEは,希少リスクと保護変異体だけがあるとき,より強力であった。VW-TOW-GEは,希少および一般的変異体の両方が存在するとき,より強力である。TOW-GEとVW-TOW-GEの両方は,原因G×Esの影響の方向に対してロバストである。COPDGene研究への適用は,著者らの提案方法が非常に有効であることを示した。結論:著者らの提案方法は,複数の形質のためのG×Esの同定における有用なツールである。提案方法は,一般的変異体に対するG×Esの同定だけでなく,希少変異体に対しても使用できる。したがって,それらはゲノムワイド関連研究および次世代配列決定データ分析の両方でG×Esの同定に使用できる。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： シミュレーション ,  *相互作用 ,  標準化 ,  *遺伝 ,  *遺伝子 ,  *多重化 ,  データ解析 ,  誤り率 ,  主成分分析 ,  ロバスト性 ,  病因
準シソーラス用語： *配列解析 ,  p値 ,  疾患遺伝子 ,  複合病 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 遺伝子-環境相互作用 ,  標準化分析 ,  Fisherの組合せ試験 ,  主成分分析

分類 (4件)： 麦  (FC03033M) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  遺伝学研究法  (EC01020N) ,  植物に対する影響  (EE04030Z)

タイトルに関連する用語 (8件)： シークエンシング ,  研究 ,  多重 ,  形質 ,  試験 ,  遺伝子 ,  環境 ,  相互作用