文献

J-GLOBAL ID：202002249383548075   整理番号：20A0200963

生細菌における天然CRISPR標的探索の直接可視化はカスケードDNAサーベイランス機構を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Direct Visualization of Native CRISPR Target Search in Live Bacteria Reveals Cascade DNA Surveillance Mechanism

著者 (11件)： Vink Jochem N.A. (Kavli Institute of Nanoscience, Department of Bionanoscience, Delft University of Technology, Van der Maasweg 9, 2629 HZ Delft, the Netherlands) ,  Martens Koen J.A. (Laboratory of Biophysics, Wageningen University & Research, Stippeneng 4, 6708 WE Wageningen, the Netherlands) ,  Martens Koen J.A. (Laboratory of Bionanotechnology, Wageningen University & Research, Bornse Weilanden 9, 6708 WG Wageningen, the Netherlands) ,  Vlot Marnix (Laboratory of Microbiology, Wageningen University & Research, Stippeneng 4, 6708 WE Wageningen, the Netherlands) ,  McKenzie Rebecca E. (Kavli Institute of Nanoscience, Department of Bionanoscience, Delft University of Technology, Van der Maasweg 9, 2629 HZ Delft, the Netherlands) ,  Almendros Cristobal (Kavli Institute of Nanoscience, Department of Bionanoscience, Delft University of Technology, Van der Maasweg 9, 2629 HZ Delft, the Netherlands) ,  Estrada Bonilla Boris (Kavli Institute of Nanoscience, Department of Bionanoscience, Delft University of Technology, Van der Maasweg 9, 2629 HZ Delft, the Netherlands) ,  Brocken Daan J.W. (Leiden Institute of Chemistry, Gorlaeus Laboratories, Leiden University, Leiden, the Netherlands) ,  Hohlbein Johannes (Laboratory of Biophysics, Wageningen University & Research, Stippeneng 4, 6708 WE Wageningen, the Netherlands) ,  Hohlbein Johannes (Microspectroscopy Research Facility, Wageningen University & Research, Stippeneng 4, 6708 WE Wageningen, the Netherlands) ,  Brouns Stan J.J. (Kavli Institute of Nanoscience, Department of Bionanoscience, Delft University of Technology, Van der Maasweg 9, 2629 HZ Delft, the Netherlands)
資料名： Molecular Cell  (Molecular Cell)
巻： 77  号： 1  ページ： 39-50.e10  発行年： 2020年 
JST資料番号： W1167A  ISSN： 1097-2765  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： CRISPR-Cas系はRNA誘導サーベイランス複合体をコードし,侵入DNA要素を発見し切断する。侵入者は細胞侵入後に中和されると考えられているが,標的探索の機構と速度論およびCRISPR保護レベルに対するその影響は不明のままである。ここでは,天然型ICRISPR-Casシステムにおける個々のカスケード複合体を可視化した。著者らは,カスケードコピー数とCRISPR干渉レベルの間の指数関係を明らかにし,侵入者複製と標的探索の間の時間駆動アームレースを指摘し,20カスケード複合体が50%保護を提供する。PAM相互作用サブユニットCas8eにより駆動され,カスケードは核様体におけるDNA(~30ms)を迅速にプローブする探索時間を半分にする。さらに,標的DNA転写とCRISPRアレイがカスケードの完全性に影響し,CRISPR干渉に影響することを示した。著者らの研究は,密集したDNA充填環境における侵入DNAのタイムリーな検出を可能にするカスケードによる細胞DNA監視の機構を確立する。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アブラヤシ ,  サブユニット ,  サーベイランス ,  干渉 ,  アーム ,  核様体 ,  RNA【核酸】 ,  顕微鏡観察 ,  完全性 ,  複合体 ,  相互作用 ,  *DNA【核酸】 ,  *細菌 ,  コピー数 ,  *可視化

著者キーワード (9件)： CRISPR-CAS ,  単一粒子追跡 ,  ターゲット探索 ,  カスケード ,  PAM ,  単一分子 ,  光活性化局在顕微鏡法 ,  パーム ,  アームレース

分類 (2件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  微生物生理一般  (EG03051L)

タイトルに関連する用語 (8件)： 細菌 ,  CRISPR ,  標的 ,  探索 ,  可視化 ,  カスケード ,  DNA ,  サーベイランス