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J-GLOBAL ID：202002249426100402   整理番号：20A2568039

PD-1/PD-L1阻害剤の部分最小二乗判別分析とアンサンブルベースフレキシブルドッキング:パイロット研究【JST・京大機械翻訳】

Partial Least-Squares Discriminant Analysis and Ensemble-Based Flexible Docking of PD-1/PD-L1 Inhibitors: A Pilot Study

著者 (9件)： Kuang Zuyin (Key Laboratory of Biorheological Science and Technology (Ministry of Education), Chongqing University, China) ,  Kuang Zuyin (College of Bioengineering, Chongqing University, China) ,  Heng Yu (College of Bioengineering, Chongqing University, China) ,  Huang Shuheng (College of Bioengineering, Chongqing University, China) ,  Shi Tingting (College of Bioengineering, Chongqing University, China) ,  Chen Linxin (College of Bioengineering, Chongqing University, China) ,  Xu Lei (College of Bioengineering, Chongqing University, China) ,  Mei Hu (Key Laboratory of Biorheological Science and Technology (Ministry of Education), Chongqing University, China) ,  Mei Hu (College of Bioengineering, Chongqing University, China)
資料名： ACS Omega  (ACS Omega)
巻： 5  号： 41  ページ： 26914-26923  発行年： 2020年 
JST資料番号： W5044A  ISSN： 2470-1343  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： プログラム細胞死蛋白質1(PD-1)/プログラム細胞死リガンド1(PD-L1)経路を標的化するmAbは,複数の型の癌に対して顕著な治療能を達成したが,経口バイオアベイラビリティおよび乏しい固形腫瘍浸透のmAb関連欠点のない小分子PD-1/PD-L1阻害剤を開発するための研究者にとって依然として大きな関心が持たれている。しかしながら,PD-1/PD-L1経路を小分子で標的化することは,PD-1/PD-L1複合体の平坦で大きな相互作用表面のため,通常,困難であると考えられている。この論文で,合計2558のPD-1/PD-L1阻害剤を最近の特許と文献から編集し,次に,部分最小二乗判別分析によってPD-1/PD-L1阻害剤の化学的空間と構造的特徴を探究するために使用した。結果は,分子内H結合,両性指数,回転半径,非結合静電エネルギー,H結合ドナーの分数van der Waals表面積,オクタノール-水分配係数,および分子量が,非阻害剤からPD-1/PD-L1阻害剤を識別する7つの重要な特徴であり,予測精度は0.90より大きいことを示した。特許BristolMyers Squibb(BMS)阻害剤と複合したPD-L1二量体の7つの結晶構造に基づいて,この非従来型結合ポケットに対する分子ドッキングの実現可能性をさらに調べた。結果は,アンサンブルベースの柔軟なドッキングプロトコルが,IC_50値とリガンド-受容体相互作用エネルギー(R=0.81)の間の強い相関で,BMS阻害剤の近天然結合立体配座を再現できることを示した。一般的に,本論文は,PD-1/PD-L1阻害剤の特徴的特徴,およびPD-L1二量体の通常でない結合ポケットのための高品質な柔軟なドッキング戦略を明らかにする。Copyright 2020 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 結晶構造 ,  浸透 ,  水素結合 ,  相互作用 ,  ドナー ,  立体配座 ,  *ドッキング ,  タンパク質 ,  二量体 ,  結合部位 ,  複合体 ,  小分子 ,  ターゲティング ,  *部分最小二乗法
準シソーラス用語： リガンド , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 腫ようの免疫療法  (GE03035B) ,  細胞生理一般  (EF02010S)

タイトルに関連する用語 (7件)： PD-1 ,  PD-L1 ,  阻害剤 ,  部分最小二乗 ,  判別分析 ,  パイロット ,  研究