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J-GLOBAL ID：202002249529437793   整理番号：20A2566034

ヒトAHR遺伝子の上流調節配列におけるCpG感染SNPのin silico同定によるEpiPol(エピジェネティクスに影響する多型)概念の導入【JST・京大機械翻訳】

An introduction to EpiPol (Epigenetic affecting Polymorphism) concept with an in silico identification of CpG-affecting SNPs in the upstream regulatory sequences of human AHR gene

著者 (5件)： Aftabi Younes (Tuberculosis and Lung Diseases Research Center, Tabriz University of Medical Sciences, P.O. Box: 5142954481, Tabriz, Iran) ,  Khoshkam Zahra (School of Biology, College of Science, University of Tehran, Tehran, Iran) ,  Amiri-Sadeghan Amir (Tuberculosis and Lung Diseases Research Center, Tabriz University of Medical Sciences, P.O. Box: 5142954481, Tabriz, Iran) ,  Khalili Yeganeh (Faculty of Dentistry, Necmettin Erbakan University, Konya, Turkey) ,  Ichihara Gaku (Department of Occupational and Environmental Health, Faculty of Pharmaceutical Sciences Tokyo University of Science, Noda, Japan)
資料名： Meta Gene  (Meta Gene)
巻： 26  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： W3470A  ISSN： 2214-5400  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： DNAメチル化,ヒストン修飾およびncRNA機能は,遺伝子発現の調節に関わる主な後成的機構であり,それらに影響する可能性のある一塩基多型(SNPs)がある。これらのSNPは遺伝子調節の遺伝的およびエピジェネティックレベルを結びつけるのに重要な役割を持つが,それらはこれまで独立したカテゴリーで分類されていない。したがって,著者らはEpiPol概念を導入し,それはpolymymorphisに影響を及ぼすエピジェネティクスを略語し,遺伝子発現の後成的調節に影響するかもしれない遺伝子の調節配列における変異を記述する。アリール炭化水素受容体(AHR)は,細胞生理学および生体異物代謝における多機能レギュレーターであり,その変化調節は,有害な発達および生理的結果を生じることが示されている。最近,AHRプロモーターのメチル化状態を調節する治療の可能性を考察した。バイオインフォマティクスアプローチを用いて,AHRの上流調節配列における多型を同定し,DNAメチル化の可能な標的として作用するCpGジヌクレオチドの導入または除去を介してそれのエピジェネティック調節に影響を及ぼす可能性がある。ATGコドンに対するAHR,-2700から+300の3000bp上流調節配列をNCBIから得た。CpGアイランドを同定し,その内に位置する105のSNPをdbSNPから検索した。その後,CpGsの導入または除去を引き起こす45のSNPをAHRの候補EpiPololとして同定した。次に,バイオインフォマティクスサーバを使用して分析したこれらのEpiPololのメチル化状態,および最終的に,13のSNPをヒトAHR遺伝子の推定メチル化推定EpiPololとして報告した。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： メチル化 ,  *遺伝 ,  *遺伝子 ,  コドン ,  ヒト ,  プロモーター領域 ,  ジヌクレオチド ,  遺伝子発現 ,  *エピジェネティクス ,  非翻訳RNA ,  DNAメチル化 ,  CpGアイランド ,  バイオインフォマティクス ,  *CpG ,  遺伝子発現調整 ,  分子遺伝現象
準シソーラス用語： 遺伝的調節 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： アリール炭化水素受容体 ,  エピジェネティクス ,  DNAメチル化 ,  CpG-SNP ,  エピポール

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (12件)： ヒト ,  AhR ,  遺伝子 ,  上流 ,  調節配列 ,  CPG ,  感染 ,  SNP ,  同定 ,  エピジェネティクス ,  多型 ,  概念