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J-GLOBAL ID：202002249587752244   整理番号：20A0792429

エコー,実行可能な軟骨細胞:健康と疾患における関節軟骨細胞研究のための計算モデル【JST・京大機械翻訳】

ECHO, the executable CHOndrocyte: A computational model to study articular chondrocytes in health and disease

著者 (18件)： Schivo Stefano (Department of Developmental BioEngineering, Technical Medicine Centre, University of Twente, Enschede, the Netherlands) ,  Schivo Stefano (Department of Formal Methods and Tools, CTIT institute, University of Twente, Enschede, the Netherlands) ,  Schivo Stefano (Department of Computer Science, Open University, Heerlen, the Netherlands) ,  Khurana Sakshi (Department of Developmental BioEngineering, Technical Medicine Centre, University of Twente, Enschede, the Netherlands) ,  Govindaraj Kannan (Department of Developmental BioEngineering, Technical Medicine Centre, University of Twente, Enschede, the Netherlands) ,  Scholma Jetse (Department of Developmental BioEngineering, Technical Medicine Centre, University of Twente, Enschede, the Netherlands) ,  Kerkhofs Johan (Prometheus, the Leuven R&D division of skeletal tissue engineering, KU Leuven, Leuven, Belgium) ,  Kerkhofs Johan (Red Cross Flanders, Mechelen, Belgium) ,  Zhong Leilei (Department of Developmental BioEngineering, Technical Medicine Centre, University of Twente, Enschede, the Netherlands) ,  Zhong Leilei (Department of Orthopaedic Surgery, University of Pennsylvania, Philadelphia, PA, USA) ,  Huang Xiaobin (Department of Developmental BioEngineering, Technical Medicine Centre, University of Twente, Enschede, the Netherlands) ,  van de Pol Jaco (Department of Formal Methods and Tools, CTIT institute, University of Twente, Enschede, the Netherlands) ,  van de Pol Jaco (Dept. of Computer Science, Aarhus University, Aarhus N, Denmark) ,  Langerak Rom (Department of Formal Methods and Tools, CTIT institute, University of Twente, Enschede, the Netherlands) ,  van Wijnen Andre J. (Department of Orthopedic Surgery, Mayo Clinic, Rochester, MN, USA) ,  Geris Liesbet (Prometheus, the Leuven R&D division of skeletal tissue engineering, KU Leuven, Leuven, Belgium) ,  Karperien Marcel (Department of Developmental BioEngineering, Technical Medicine Centre, University of Twente, Enschede, the Netherlands) ,  Post Janine N. (Department of Developmental BioEngineering, Technical Medicine Centre, University of Twente, Enschede, the Netherlands)
資料名： Cellular Signalling  (Cellular Signalling)
巻： 68  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： T0667A  ISSN： 0898-6568  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 計算モデリングは,生物学における複雑なシグナル伝達ネットワークを研究するために用いることができる。しかしながら,ほとんどのモデリングツールは,数学においてほとんど背景のない分子細胞生物学者に適していない。動的ネットワークの研究のための視覚ベースのモデリングツールを構築した。ここでは,関連するシグナル伝達経路のパネルが統合されている軟骨発生と変形性関節症の計算モデルの開発について述べる。in silico実験により,各経路成分の役割を洞察し,摂動が細胞及び組織の基底健康状態を調節することを明らかにした。著者らは,以前に開発された相互作用モデリング(ANIMO)によるネットワークの計算モデリングツール解析を用いて,50ノードと200の相互作用を含むネットワークをもたらす7つのシグナル伝達経路を統合する活性ネットワークを生成した。細胞運命決定の分子機構を特性化するため,in silico実験を行った。モデルを用いて,入力として種々の幹細胞源のRNA配列データを用いて細胞分化中の生物学的シナリオを模倣した。症例研究において,DKK1(Dickkopf-1)とFRZB(Frizzled関連蛋白質,WNT拮抗剤)とGREM1(グリムリン1,BMP拮抗剤)の発現がIL1β(インターロイキン1β)誘導MMP(マトリックスメタロプロテイナーゼ)発現を防止し,それにより少なくとも短期間で軟骨変性を防止するというモデル誘導仮説を検討した。著者らは,DKK1,FRZBおよびGREM1の組み合わせが,ヒト初代軟骨細胞におけるIL1β誘導炎症の影響を調節する役割を果たす可能性があることを見出した。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 炎症 ,  幹細胞 ,  インターロイキン ,  視覚 ,  *計算モデル ,  RNA【核酸】 ,  摂動 ,  ネットワーク ,  細胞分化 ,  相互作用 ,  *軟骨 ,  *軟骨細胞 ,  ヒト ,  タンパク質 ,  マトリックスメタロプロテイナーゼ

著者キーワード (10件)： 軟骨 ,  軟骨細胞 ,  インターロイキン-1ベータ ,  関節症 ,  計算モデル ,  アニメーション ,  肥大 ,  エコー ,  RUNX2 ,  SOX9

分類 (2件)： 細胞生理一般  (EF02010S) ,  運動器系の基礎医学  (GG01020B)

タイトルに関連する用語 (6件)： エコー ,  軟骨細胞 ,  疾患 ,  関節軟骨細胞 ,  研究 ,  計算モデル