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J-GLOBAL ID：202002249957974198   整理番号：20A2086376

Tecomella undulata(Sm.)シームに対するFamily Bignoniaceae科の他のメンバーからのマイクロサテライトマーカーの交差属伝達性【JST・京大機械翻訳】

Cross genera transferability of microsatellite markers from other members of family Bignoniaceae to Tecomella undulata (Sm.) Seem

著者 (3件)： Kalia Rajwant K. (Division of Plant Improvement and Pest Management, Central Arid Zone Research Institute (CAZRI), Jodhpur, Rajasthan, India) ,  Chhajer Sidhika (Division of Plant Improvement and Pest Management, Central Arid Zone Research Institute (CAZRI), Jodhpur, Rajasthan, India) ,  Pathak Rakesh (Division of Plant Improvement and Pest Management, Central Arid Zone Research Institute (CAZRI), Jodhpur, Rajasthan, India)
資料名： Acta Physiologiae Plantarum  (Acta Physiologiae Plantarum)
巻： 42  号： 9  ページ： 151  発行年： 2020年 
JST資料番号： W3992A  ISSN： 1861-1664  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 関連する種/遺伝子からのSSRマーカーの伝達性は,遺伝的に無視された作物のゲノムデータベースを増強するための迅速で費用対効果の高い方法である。超乾燥地域で見出された薬理学的に重要な絶滅危惧樹木であるMonotype属Tecomella undultaは,SSR同定も交差移動性研究も開始されていないそのような遺伝的資源制限種の一つである。ファミリービッグノ科(Incarvillea sinensis,I.mairei,Jacaranda copaia,Tabebuia aureaとArrabidaea chica)の他のメンバーから選択した69の交差遺伝子SSRプライマーの移植性は,T.undulataの24の系統において80から600bpのサイズで1-10のアンプリコンを増幅する40.58%(28のプライマー)伝達性を示した。試験した属の間で,%のマーカー伝達性は,66.67%(A.chica)から38.89%(J.copaia)まで変化し,一方,移動可能なマーカーは,I.sinensisから同定できなかった。単純ジ-/トリヌクレオチド反復(34.2~37.5%)と複合ヌクレオチド配列(60.0%)に基づくSSRモチーフの転移性は,ペンタ-/ヘキサ-ヌクレオチドに基づく反復モチーフと比較して高かった。28の移植可能マーカーの中で,26(92.86%)は多型であったが,2(7.14%)は単形であった。プライマー当たりの対立遺伝子の平均数は5.39であったが,遺伝子座当たりの平均多型対立遺伝子は5.11であった。SSRマーカーのPIC値は0.23~0.85で,平均0.59であった。同定した交雑種SSRマーカーの効率を,一連の24樹木(黄色,オレンジおよび赤花色形態型)を用いて多様性解析に対して試験した。24のサンプルは,0.29から0.67の範囲の類似係数を有する6つの群にクラスタ化し,一方,6つの系統は,異なるグループを形成した。SSR系統樹における系統の分布は,花色との相関を示さなかった。より多くの多様性(99%)が個体群間に存在するもの(1%)と比較して個体群内で観察された。本研究は,遺伝的多様性研究,QTLのマッピング,および品種同定のために適用可能な,コンカミア種から適切な多型マーカーを同定することによって,T.undulataのゲノム背景を豊かにする。Copyright Franciszek Gorski Institute of Plant Physiology, Polish Academy of Sciences, Krakow 2020 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 農作物 ,  *遺伝 ,  遺伝子 ,  オレンジ ,  ヌクレオチド ,  ヌクレオチド配列 ,  系統樹 ,  クラスタ化 ,  ゲノム ,  生物絶滅 ,  品種 ,  対立遺伝子 ,  個体群
準シソーラス用語： アンプリコン ,  *マイクロサテライトマーカー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 乾燥地域 ,  絶滅危惧樹木 ,  交差伝達性 ,  Rohida ,  SSRマーカー

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (5件)： Sm ,  シーム ,  メンバー ,  マイクロサテライトマーカー ,  交差