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J-GLOBAL ID：202002250965803569   整理番号：20A2670627

LTRレトロトランスポゾンのゲノム分布特性と時空間発現パターンを分析した。【JST・京大機械翻訳】

Investigation of Genome-Wide Distribution and Spatio-Temporal Expression Patterns of LTR Retrotransposons in Chlamys farreri

著者 (6件)： Liu Panpan (中国海洋大学海洋生命学院,海洋生物遺伝学与育種教育部重点実験室,山東青島266003) ,  Li Yuli (中国海洋大学海洋生命学院,海洋生物遺伝学与育種教育部重点実験室,山東青島266003;海洋生物学与生物技術功能実験室,青島海洋科学与技術試点国家実験室,山東青島266237) ,  Liu Fuyun (中国海洋大学海洋生命学院,海洋生物遺伝学与育種教育部重点実験室,山東青島266003) ,  Yu Hongwei (中国海洋大学海洋生命学院,海洋生物遺伝学与育種教育部重点実験室,山東青島266003) ,  Bao Zhenmin (中国海洋大学海洋生命学院,海洋生物遺伝学与育種教育部重点実験室,山東青島266003;海洋漁業科学与食物産出過程功能実験室,青島海洋科学与技術試点国家実験室,山東青島266237) ,  Wang Shi (中国海洋大学海洋生命学院,海洋生物遺伝学与育種教育部重点実験室,山東青島266003;海洋生物学与生物技術功能実験室,青島海洋科学与技術試点国家実験室,山東青島266237)
資料名： Zhongguo Haiyang Daxue Xuebao. Zirankexueban  (Zhongguo Haiyang Daxue Xuebao. Zirankexueban)
巻： 50  号： 10  ページ： 47-54  発行年： 2020年 
JST資料番号： C2597A  ISSN： 1672-5174  CODEN： ZHDXB3  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 長い末端反復配列(LTR)レトロトランスポゾンは真核生物において普遍的に存在し、“複製-粘着”方式によりゲノムの他の位置に挿入し、遺伝子の活性及びゲノムの構造に影響する。DNAシークエンシング技術の迅速な発展は分子生物学研究に大量のグループ学資源を提供し、全ゲノムレベルのレトロトランスポゾンの系統的な分析にデータサポートを提供した。本研究では、すでに公表されたホタテガイ(Chlamysfarreri)のゲノム情報に基づいて、ホタテガイLTRレトロトランスポゾンのゲノム分布特徴及び胚発生の各時期と成体の各組織の発現パターンを系統的に分析した。その結果,LTRの全長さは染色体長と正に相関し,LTR密度(Mb染色体当たりのLTRコピー数)は染色体長と負の相関を示した。Gypsy,NgaroとDIRSは,最も長い長さの3つのLTRサブファミリーであり,主に遺伝子間領域に分布する。他の種類のLTR、GypsyとNgaroは胚発生の各時期と各成体組織/器官において、顕著な発現優位性があり、また、胚発生過程において動的発現パターンを呈する。その中、発現量のピークと低谷は、それぞれ担輪幼虫の時期と殻頂幼虫の時期に現れる。GypsyとNgaroは大部分の組織/器官において発現優位を占め、唯一の例外的な組織は肝膵臓であり、その発現量が最も高いLTRタイプはERV1である。本研究は,トランスポゾンのレトロトランスポゾンのゲノム分布特性及び時空間的発現パターンに関する系統的分析がトランスポゾンの機能及びゲノム進化に対する作用を更に理解するための重要な手がかりを提供した。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 染色体 ,  胚発生 ,  幼虫 ,  *ゲノム ,  分子生物学 ,  成体 ,  真核生物 ,  ホタテガイ ,  *トランスポゾン ,  LTR【ウイルス】 ,  コピー数 ,  *レトロトランスポゾン
準シソーラス用語： DNA配列解析 ,  ゲノム進化 ,  *遺伝子発現パターン , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 魚類  (FH02020K) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (7件)： LTR ,  レトロトランスポゾン ,  ゲノム ,  布特性 ,  時空間 ,  発現パターン ,  分析