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J-GLOBAL ID：202002251067766755   整理番号：20A2755490

RNA-Seqにより明らかにされたスイートオレンジの干ばつ耐性に関連する台木誘導分子応答【JST・京大機械翻訳】

Rootstock-induced molecular responses associated with drought tolerance in sweet orange as revealed by RNA-Seq

著者 (6件)： Goncalves Luana P. (Centro de Biotecnologia e Genetica, Departamento de Ciencias Biologicas, Universidade Estadual de Santa Cruz, Ilheus, Brazil) ,  Camargo Raquel L. Boscariol (Centro APTA Citros Sylvio Moreira, Instituto Agronomico, Cordeiropolis, Brazil) ,  Takita Marco Aurelio (Centro APTA Citros Sylvio Moreira, Instituto Agronomico, Cordeiropolis, Brazil) ,  Machado Marcos A. (Centro APTA Citros Sylvio Moreira, Instituto Agronomico, Cordeiropolis, Brazil) ,  Filho Walter S. dos Soares (Embrapa Mandioca e Fruticultura, Cruz das Almas, Brazil) ,  Costa Marcio G. C. (Centro de Biotecnologia e Genetica, Departamento de Ciencias Biologicas, Universidade Estadual de Santa Cruz, Ilheus, Brazil)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 20  号： 1  ページ： 1-14  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 柑橘類植物は,乾燥耐性を含む多くの園芸形質に影響する台木品種によって,移植によって商業的に伝播する。柑橘類の繁殖に利用できる異なる台木品種の中で,「Rの石灰は,他の柑橘類の台木と比較して,干ばつに対する耐性を高めることが知られている。本研究の目的は,スイートオレンジにおける台木誘発干ばつ耐性の根底にある十分に理解されていない分子応答を調査することであった。Illumina HiSeqプラットフォームを用いて,温室条件下で,対照および干ばつストレス処理を受けた「RRangpur’石灰に接したスイートオレンジの葉において,RNA-Seqトランスクリプトーム解析を行った。全部で41,827のユニークな転写物を同定し,そのうち1764の転写産物が処理間で有意な変動(P≦0.001)を示し,乾燥ストレス処理により1081の遺伝子と683の抑制された。転写物は,細胞成分,分子機能および生物学的過程の44の異なるカテゴリーに分布した。細胞壁,炭水化物および抗酸化剤の代謝,光反応,生物的および非生物的ストレス応答,およびアブシジン酸(ABA)およびエチレンシグナル伝達経路に関与する蛋白質を含む,細胞代謝に関連するいくつかの遺伝子は,干ばつストレスによって異なって調節された。RNA-Seqデータは,定量的リアルタイムPCR(qPCR)分析により検証され,乾燥耐性および感受性台木に移植されたスイートオレンジ間の選択遺伝子の発現の比較分析は,柑橘類における耐干性のための新しい候補遺伝子を明らかにした。結論として,著者らの結果は,代謝,細胞応答および調節における機能を有する,比較的小さいが機能的に多様な甘いオレンジトランスクリプトームの画分のみが,干ばつストレスによって異なって調節されることを示した。データは,スイートオレンジにおける台木誘発干ばつ耐性が,細胞壁,可溶性炭水化物および抗酸化代謝,生物的および非生物的ストレス応答,TFs,PKsおよびABAシグナル伝達経路,および澱粉代謝,光反応およびエチレンシグナル伝達に関与する遺伝子のダウンレギュレーションを含む遺伝子の転写活性化を含むことを示唆する。それらの機能的役割を解明し,柑橘類の遺伝的改良におけるそれらの可能性を探るための今後の努力は,このデータから利益を得るべきである。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  *オレンジ ,  細胞壁 ,  タンパク質 ,  澱粉 ,  *干ばつ ,  品種 ,  *台木 ,  ダウンレギュレーション ,  トランスクリプトーム ,  定量的PCR法 ,  アルケン
準シソーラス用語： 乾燥ストレス ,  非生物的ストレス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 柑橘類 ,  トランスクリプトーム ,  水不足 ,  非生物的ストレス

分類 (2件)： 果樹  (FC03042G) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

物質索引 (1件)： エチレン

引用文献 (56件)：

• FAOSTAT online database. Food and Agriculture Organization of the United Nations; 2017; citation_id=CR1
• Agrometeorologia dos citros; Citros; 2005; 317-344; CR2; PC Sentelhas; citation_publisher=Instituto Agronômico e Fundag
• Trends Plant Sci; Conceptual framework for drought phenotyping during molecular breeding; GH Salekdeh, M Reynolds, J Bennett, J Boyer; 14; 2009; 488-496; 10.1016/j.tplants.2009.07.007; citation_id=CR3
• J Exp Bot; Mechanisms underlying plant resilience to water deficits: prospects for water-saving agriculture; MM Chaves, MM Oliveira; 55; 2004; 2365-2384; 10.1093/jxb/erh269; citation_id=CR4
• Physiol Plant; Responses to flooding and drought stress by two citrus rootstocks seedlings with different water-use efficiency; F García-Sánchez, JP Syvertsen, V Gimeno, P Botía, JG Pérez-Pérez; 130; 2007; 532-542; 10.1111/j.1399-3054.2007.00925.x; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (7件)： RNA-seq ,  スイートオレンジ ,  干ばつ耐性 ,  台木 ,  誘導 ,  分子 ,  応答