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J-GLOBAL ID:202002251095411503   整理番号:20A0208776

生物物理学的モデリングのためのNichemapr-Rパッケージ ECTERMと動的エネルギー収支モデル【JST・京大機械翻訳】

NicheMapR - an R package for biophysical modelling: the ectotherm and Dynamic Energy Budget models
著者 (2件):
資料名:
巻: 43  号:ページ: 85-96  発行年: 2020年 
JST資料番号: W1706A  ISSN: 0906-7590  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
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機構的ニッチモデルは,その熱,水及び栄養収支に関する熱力学的制約を決定することにより,生物の基本的なニッチを特性化し,成長,発達及び生殖に対するこれらの結果に影響を及ぼす。したがって,それらは,生存,活性および最終的に,環境条件の配列および重要な形態学的,生理学的および行動的機能的特性を与えられた個体群成長を決定する重要な速度に関する制約を定量化することができる。ここでは,任意の種類の外温生物とその環境の間の熱,水,エネルギーおよび物質交換の機構的モデリングのための一連のプログラムを含むRパッケージ,NicheMapRの外熱モデルを紹介し,文書化した。NicheMapR外気温モデルは,最初にPorter,MitchellおよびBeckmanにより開発されたFortranプログラムに基づいており,微気候条件および挙動熱規制の関数としてコア体温および蒸発水損失を予測した。モデルは,NicheMapR微気候モデルによって計算されるように,2つの極端な微気候(最小と最大の日陰)を与えられた定常状態体温と蒸発水損失を計算するためのルーチンを含んでいる。行動選択には,姿勢と色変化,シェード探索,パンティング,登坂,および再処理を含む。ここでは,NicheMapRパッケージの一部としてRから呼ばれるプログラムを構成し,動的エネルギーBudget理論を用いて全ライフサイクルエネルギーと水収支をモデル化するための新しい機能を含むモデルを詳細に記述した。著者らは,DEBモデルを実行するための独立したRスクリプトだけでなく,外熱モデルのコア操作のためのスクリプトを含んでいる。例として,本論文では,関連するvigネットにおける応用例を示した。統合された微気候および外気温モデルは,外生生物の挙動,分布および豊度に及ぼす環境変化の影響を決定するための強い熱力学的基礎を提供するはずである。Copyright 2020 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (1件):
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個体群生態学 
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