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J-GLOBAL ID：202002251112262579   整理番号：20A1387436

三穂アヒルORAI1遺伝子SNPsスクリーニング及びバイオインフォマティクス分析【JST・京大機械翻訳】

Screening of SNPs and Bioinformatics Analysis of ORAI1 Gene in Sansui Duck

著者 (5件)： Tan Guanghui (貴州大学動物科学学院/高原山地動物遺伝育種与繁殖教育部重点実験室,貴州貴陽,550025) ,  Zhang Yiyu (貴州大学動物科学学院/高原山地動物遺伝育種与繁殖教育部重点実験室,貴州貴陽,550025) ,  Wu Lei (貴州大学動物科学学院/高原山地動物遺伝育種与繁殖教育部重点実験室,貴州貴陽,550025) ,  Tan Yuanyu (貴州大学動物科学学院/高原山地動物遺伝育種与繁殖教育部重点実験室,貴州貴陽,550025) ,  Li Jiezhang (貴州大学動物科学学院/高原山地動物遺伝育種与繁殖教育部重点実験室,貴州貴陽,550025)
資料名： Henan Nongye Kexue  (Henan Nongye Kexue)
巻： 49  号： 4  ページ： 153-159  発行年： 2020年 
JST資料番号： C2918A  ISSN： 1004-3268  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： カルシウム放出酵素活性化カルシウム変調器1(ORAI1)と三穂アヒルの卵殻品質との相関性を検討するため、三穂アヒルDNA混合プールを構築し、PCR増幅と直接シークエンシング法により、三穂アヒルORAI1遺伝子に対して一塩基多型(SNP)検出を行った。さらに、三穂アヒルの卵殻品質に顕著に影響するSNPsを選別し、同時に三穂アヒルORAI1遺伝子コードのタンパク質に対して機能予測を行った。結果は,3穂アヒルORAI1遺伝子が263のアミノ酸をコード化し,不安定な親水性蛋白質を構成し,蛋白質の二次構造は,主にαヘリックス,ランダムコイル,伸長鎖,およびβ回転角から成ることを示した。3つのSNPsを増幅セグメントで発見し、それぞれT84C、C188T、A471Gであり、いずれも同義突然変異であり、アミノ酸の変化を引き起こさなかったが、この遺伝子のmRNAの二次構造と自由エネルギーの変化を引き起こし、各突然変異部位は突然変異前後の対立遺伝子頻度に差異がある。以上の結果は、ORAI1遺伝子には3つのSNPsがあり、卵殻の品質分子マーカー部位の参考になることを示唆した。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アミノ酸 ,  DNA【核酸】 ,  mRNA ,  *遺伝子 ,  タンパク質 ,  突然変異 ,  *アヒル ,  卵殻 ,  二次構造 ,  *スクリーニング ,  PCR法 ,  *一塩基多型
準シソーラス用語： 配列解析 ,  *バイオインフォマティクス ,  αヘリックス , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 家禽一般  (FD03010U) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (7件)： アヒル ,  Orai1 ,  遺伝子 ,  SNPs ,  スクリーニング ,  バイオインフォマティクス ,  分析