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J-GLOBAL ID：202002251160437193   整理番号：20A2696271

カルバペネム耐性高病原性ST11-K64肺炎桿菌の院内発生における急速な遺伝子獲得と損失の同時発生【JST・京大機械翻訳】

Co-occurrence of Rapid Gene Gain and Loss in an Interhospital Outbreak of Carbapenem-Resistant Hypervirulent ST11-K64 Klebsiella pneumoniae

著者 (11件)： Zhang XiaoTuan (Clinical Laboratory, The Second Affiliated Hospital, University of South China, Hengyang, China) ,  Ouyang JingLin (Department of Ultrasound Medicine, The Second Affiliated Hospital, University of South China, Hengyang, China) ,  He WenWen (Clinical Laboratory, The Second Affiliated Hospital, University of South China, Hengyang, China) ,  Zeng Tong (Clinical Laboratory, The Second Affiliated Hospital, University of South China, Hengyang, China) ,  Liu Bin (Clinical Laboratory, The Second Affiliated Hospital, University of South China, Hengyang, China) ,  Jiang Hongtao (Department of Organ Transplantation, The Second Affiliated Hospital, Hainan Medical University, Haikou, China) ,  Zhang Yunsheng (Clinical Research Center, The Second Affiliated Hospital, University of South China, Hengyang, China) ,  Zhou Linlin (Clinical Research Center, The Second Affiliated Hospital, University of South China, Hengyang, China) ,  Zhou Haijian (State Key Laboratory for Infectious Disease Prevention and Control, National Institute for Communicable Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Beijing, China) ,  Liu Zhuoran (Clinical Laboratory, The Second Affiliated Hospital, University of South China, Hengyang, China) ,  Liu Logen (Clinical Research Center, The Second Affiliated Hospital, University of South China, Hengyang, China)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 11  ページ： 579618  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 頻繁な患者移動を受ける2つの病院におけるカルバペネマーゼ産生高病原性肺炎桿菌の流行を報告する。11の完全に組み立てられたゲノムの解析は,細菌がST11-K64菌株であることを示した。さらに,12の一塩基多型(SNP)は,同じクラスタに由来する株を同定し,また感染の院内感染を示した。5つのプラスミドを,菌株のそれぞれに組み立てた。1つのプラスミドは,莢膜多糖調節因子rmpAとrmpA2を含むいくつかの病原性遺伝子を持っていた。2つの他は,カルバペネム耐性,bla_KPC-2の1つを含む抗菌剤耐性遺伝子を持っていた。比較ゲノム分析は,同じ病棟において,伝播と子孫株の共存に沿ったゲノム内容の頻繁で迅速な増加と損失の発生を示した。挿入配列により逃げられた抗菌耐性付与遺伝子を有する10kbp断片は,患者3のKP20194c株からのプラスミドで欠損し,この株は,その後,患者4を感染させた。しかし,10-kbp断片を含む株は,また,ほぼ同時に病棟環境から分離され,異なる染色体インデルを持っていた。Tn1721と複数の付加的挿入配列仲介転位も見られた。これらの結果は,移動遺伝要素によって促進されるK.pneumoniaeのゲノムプールの急速な再形成と多様化があり,発生開始の短い時間でさえあることを示した。ST11-K64 CR-hvKP株は,新しい重要なスーパーバッグと公衆衛生への脅威になる可能性を有する。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 細菌 ,  *遺伝子 ,  染色体 ,  抗細菌薬 ,  ゲノム ,  *病原性 ,  クラスタ ,  プラスミド ,  公衆衛生 ,  *肺炎桿菌 ,  院内感染 ,  挿入配列
準シソーラス用語： 耐性遺伝子 ,  カルバペネマーゼ ,  *カルバペネム耐性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 肺炎桿菌 ,  抗生物質耐性 ,  毒性因子 ,  マイクロ進化 ,  モバイル遺伝要素

分類 (3件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  病原体に作用する抗生物質の基礎研究  (GX05020C) ,  微生物感染の生理と病原性  (EG03053T)

引用文献 (38件)：

• AlikhanN. F.PettyN. K.Ben ZakourN. L.BeatsonS. A. B. L. A. S. T. (2011). Ring Image Generator (BRIG): simple prokaryote genome comparisons. BMC Genom. 12:402. doi: 10.1186/1471-2164-12-402 21824423
• BankevichA.NurkS.AntipovD.GurevichA. A.DvorkinM.KulikovA. S. (2012). SPAdes: a new genome assembly algorithm and its applications to single-cell sequencing. J. Comput. Biol. 19 455-477. doi: 10.1089/cmb.2012.0021 22506599
• BrinkA. J. (2019). Epidemiology of carbapenem-resistant Gram-negative infections globally. Curr. Opin. Infect. Dis. 32 609-616. doi: 10.1097/QCO.0000000000000608 31567571
• ChenL.MathemaB.PitoutJ. D.DeLeoF. R.KreiswirthB. N. (2014). Epidemic Klebsiella pneumoniae ST258 is a hybrid strain. mBio. 5 e1355-e1314. doi: 10.1128/mBio.01355-14 24961694
• CLSI (2019). “Performance standards for antimicrobial susceptibility testing,” in CLSI Supplement M100, 29th Edn (Wayne, PA: Clinical and Laboratory Standards Institute).

タイトルに関連する用語 (7件)： カルバペネム耐性 ,  病原性 ,  肺炎桿菌 ,  遺伝子 ,  獲得 ,  損失 ,  同時発生