トランスクリプトーム解析は,TOFおよびASDを有する小児における心筋遺伝子サインを定義し,心肺バイパス手術に応答する疾患特異的分子再プログラミングを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Raggi Federica; Cangelosi Davide; Becherini Pamela; Becherini Pamela; Blengio Fabiola; Blengio Fabiola; Morini Martina; Acquaviva Massimo; Acquaviva Massimo; Belli Maria Luisa; Belli Maria Luisa; Panizzon Giuseppe; Cervo Giuseppe; Varesio Luigi; Eva Alessandra; Bosco Maria Carla

文献

J-GLOBAL ID：202002251498176676 整理番号：20A1015568

トランスクリプトーム解析は,TOFおよびASDを有する小児における心筋遺伝子サインを定義し,心肺バイパス手術に応答する疾患特異的分子再プログラミングを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Transcriptome analysis defines myocardium gene signatures in children with ToF and ASD and reveals disease-specific molecular reprogramming in response to surgery with cardiopulmonary bypass

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資料名：
巻： 18 号： 1 ページ： 1-20 発行年： 2020年
JST資料番号： U7330A ISSN： 1479-5876 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：イギリス (GBR) 言語：英語 (EN)

ファロー(ToF)の四徴症と心房中隔欠損症(ASD)は,先天性心疾患の最も一般的な型であり,小児罹患率と死亡率の主要な原因である。心肺バイパス(CPB)は,循環と心臓安定化をサポートするために,修正心臓手術の間に使用される。しかし,この手順は全身性炎症およびストレス応答を誘発し,術後合併症のリスクを増加させる。本研究の目的は,ToFとASDの病因の分子基盤とCPBに対する反応を定義し,新しい潜在的バイオマーカーを同定することであった。10人のToFおよび10人のASD患者から採取した右心房標本の比較トランスクリプトーム分析を,(CPB前)および(CPB後)補正手術後に行った。各試料から分離した全RNAを,38,500のユニークなヒト遺伝子を含むAffymetrix HG-U133 Plus Array Strips上で個別にハイブリダイゼーションした。遺伝子発現プロファイルと機能的濃縮/ネットワーク分析の違いを生物情報学的ツールを用いて評価した。qRT-PCR分析を用いて遺伝子調節を検証した。前CPB試料は合計72の遺伝子の有意差次的発現を示し,そのうちの28はToFで過剰発現し,44はASDで過剰発現した。遺伝子オントロジーアノテーションによると,大部分の濃縮された生物学的プロセスは,ToFにおけるマトリックス組織化と細胞接着,およびASD標本における筋肉発生と収縮性によって表された。GSEAは,ToF試料における低酸素遺伝子セットの特異的濃縮を強調し,疾患病因における低酸素の役割を指摘した。CPB後心筋は,転写調節,成長/アポトーシス,炎症,接着/マトリックス組織化および酸化ストレスに関連する遺伝子の発現プロファイルに有意な変化を示した。それらの間で,70のみが2つの疾患群に共通していたが,110と24はそれぞれToFとASDにおいて独特であった。差別的に発現した遺伝子産物間の複数の機能的相互作用をネットワーク分析により予測した。興味深いことに,ASD試料における遺伝子発現変化は,コンセンサス低酸素プロファイルに従った。著者らの結果は,CPB前後のToFおよびASD患者の右心房組織における遺伝子再プログラミングの包括的見解を提供し,CPBに対する疾患病態生理および心筋反応の基礎となる特異的分子経路を定義する。これらの知見は,それらが新しい候補予後マーカーを同定し,心臓保護後外科療法を調整するための標的となる可能性がある。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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循環系疾患の外科療法 , 循環系の基礎医学

引用文献 (95件)：

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