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J-GLOBAL ID：202002251548991270   整理番号：20A0630154

Musa生殖質系統間のレトロトランスポゾンに基づく遺伝的多様性と系統発生分析【JST・京大機械翻訳】

Inter retrotransposon based genetic diversity and phylogenetic analysis among the Musa germplasm accessions

著者 (7件)： Saraswathi Marimuthu Somasundaram (ICAR - National Research Centre for Banana, Tiruchchirappalli, Tamil Nadu, India) ,  Uma Subbaraya (ICAR - National Research Centre for Banana, Tiruchchirappalli, Tamil Nadu, India) ,  Ramaraj Sathasivam (ICAR - National Research Centre for Banana, Tiruchchirappalli, Tamil Nadu, India) ,  Durai Palani (ICAR - National Research Centre for Banana, Tiruchchirappalli, Tamil Nadu, India) ,  Mustaffa Mohamed M. (ICAR - National Research Centre for Banana, Tiruchchirappalli, Tamil Nadu, India) ,  Kalaiponmani Kalaimughilan (ICAR - National Research Centre for Banana, Tiruchchirappalli, Tamil Nadu, India) ,  Chandrasekar Arumugam (ICAR - National Research Centre for Banana, Tiruchchirappalli, Tamil Nadu, India)
資料名： Journal of Plant Biochemistry and Biotechnology  (Journal of Plant Biochemistry and Biotechnology)
巻： 29  号： 1  ページ： 114-124  発行年： 2020年 
JST資料番号： W4648A  ISSN： 0971-7811  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究では,IRAPマーカーを用いてICAR-NRCB圃場遺伝子バンクで入手可能なMusa生殖質におけるレトロエレメントの挿入多型を研究した。多型バンドの最大数はプライマー対NikitaとLTR 6150(48)により生産され,LTR 6149と3′LTR(47)が続き,35バンドの最小値はプライマー対SukkulaとLTR 6150により生産された。生成したバンドを0(不在)と1(存在)として記録し,得られた二成分データを多様性解析にかけた。系統樹は,EumusaとRhodochlamysのメンバーを持つ2つの主要クラスターから成り,それらの遺伝的親密性と他のクラスターにおけるEnsete属のメンバーを示した。主座標解析の結果は,階層的クラスタ分析で得られたものと一致した。本研究で用いた分子マーカーは,0.41から0.99までの範囲の類似性を有するMusa生殖質系統の間の内部および群間の多様性を明らかにすることができた。IRAPマーカーシステムは,ゲノムとサブグループレベルの両方に基づいて系統を優れたクラスタ化を行った。全生殖質は,ICAR-NRCB圃場遺伝子バンクで利用可能な多様な系統群を示す重複なしでロバストであることが分かった。それはまた,高い多型性を示し,したがって,Musaの多様なゲノムの間の遺伝的関連性を検出するために,効果的に使用することができた。Copyright Society for Plant Biochemistry and Biotechnology 2019 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ゲノム ,  系統樹 ,  *レトロトランスポゾン ,  クラスタ ,  クラスタ化 ,  座標解析 ,  ロバスト性 ,  *遺伝 ,  類似性
準シソーラス用語： 分子マーカー ,  多様性解析 ,  ジーンバンク ,  *系統解析 ,  *遺伝多様性 ,  *生殖質 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： MUSA ,  分子特性化 ,  遺伝的多様性 ,  IRAPマーカー

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (6件)： Musa ,  生殖質 ,  系統 ,  レトロトランスポゾン ,  遺伝的多様性 ,  系統発生分析