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J-GLOBAL ID：202002251745089668   整理番号：20A0503074

すい管腺癌の異常なエピジェネティック変化の複合分析【JST・京大機械翻訳】

Combined Analysis of the Aberrant Epigenetic Alteration of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma

著者 (7件)： Xu Rui ( Department of Radiology, Guizhou Provincial People’s Hospital, Guiyang, Guizhou, China) ,  Xu Qiuyan ( Department of Oral and Maxillofacial Surgery, Guizhou Provincial People’s Hospital, Guiyang, Guizhou, China) ,  Huang Guanglei ( Department of Oral and Maxillofacial Surgery, Guizhou Provincial People’s Hospital, Guiyang, Guizhou, China) ,  Yin Xinhai ( Department of Oral and Maxillofacial Surgery, Guizhou Provincial People’s Hospital, Guiyang, Guizhou, China) ,  Zhu Jianguo ( Department of Urology, Guizhou Provincial People’s Hospital, Guiyang, Guizhou, China) ,  Peng Yikun ( Department of Otorhinolaryngology-Head and Neck Surgery, Guizhou Provincial People’s Hospital, Guiyang, Guizhou, China) ,  Song Jukun ( Department of Oral and Maxillofacial Surgery, Guizhou Provincial People’s Hospital, Guiyang, Guizhou, China)
資料名： BioMed Research International (Web)  (BioMed Research International (Web))
巻： 2019  ページ： Null  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7008A  ISSN： 2314-6133  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景.膵管腺癌(PDAC)は,その高い罹患率と死亡率のため,最も致命的悪性腫瘍の1つである。DNAメチル化はPDACの発生に重要な役割を果たす。しかしながら,DNAメチル化とmRNAの間の相互作用の機構的役割はトランスクリプトーム変化に関する後成的調節因子として,また生存のような臨床転帰との相関は癌においてほとんど明らかにされていない。したがって,PDACの発生における異常な後成的変化の解明は,解決すべき緊急の問題である。本研究では,癌発生時の異常DNAメチル化駆動癌遺伝子を同定するためにPDACの統合的後成的解析を行った。【方法】DNAメチル化マトリックスとmRNAプロファイルを,TCGAデータベースから得た。メチル化と遺伝子発現データセットの統合を,Rパッケージ・メチルミックスを用いて分析した。低メチル化/過剰メチル化を有する遺伝子は,カプランマイアー分析でさらに検証された。遺伝子発現と異常DNAメチル化の相関分析も行った。著者らは,ConsensisPathDBを用いて,メチルMix基準によって同定された異常なDNGメチル化遺伝子に関する経路解析を行った。結果:メチル化データとmRNAデータの両方を有する188人の患者が適格と考えられた。混合モデルを構築し,Wilcoxonランク検定を用いて正常および腫瘍群における異なるメチル化遺伝子を実行した。包含基準により,95の異なるメチル化遺伝子を検出した。これらの遺伝子の中で,74の過剰メチル化と21の低メチル化遺伝子が見出された。経路分析は,ATP感受性カリウムチャンネル,Robo4,およびVEGFシグナル伝達経路クロストークおよび一般的転写経路に関与する遺伝子の過剰メチル化の増加を明らかにした。結論.膵管腺癌における異常な後成的変化の統合分析は,異なるメチル化遺伝子が生物情報科学分析によりPDACの発生において重要な役割を果たすことを示した。本研究は,PDACにおける差別的にメチル化された発現遺伝子および経路の機能に関する臨床医の詳細化を助けることができる。cdo1,GJD2,ID4,Nol4,PAX6,TRIM58およびZNF382は,将来のPDACの早期スクリーニングおよび治療のための異常DNAメチル化バイオマーカーとして作用する可能性がある。Copyright 2019 Rui Xu et al. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： メチル化 ,  スクリーニング ,  癌遺伝子 ,  発癌 ,  mRNA ,  遺伝子発現 ,  バイオマーカー ,  腫瘍 ,  遺伝子 ,  VEGF ,  データベース ,  トランスクリプトーム ,  死亡率 ,  クロストーク ,  *エピジェネティクス

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

引用文献 (55件)：

• N. J. Vogelzang, S. I. Benowitz, S. Adams et al., "Clinical cancer advances 2011: annual report on progress against cancer from the American society of clinical oncology," Journal of Clinical Oncology, vol. 30, no. 1, pp. 88-109, 2012.
• W. Chen, R. Zheng, S. Zhang, P. Zhao, H. Zeng, X. Zou, "Report of cancer incidence and mortality in China, 2010," The Annals of Translational Medicine, vol. 2, pp. 61, 2014.
• R. L. Siegel, K. D. Miller, A. Jemal, "Cancer statistics, 2017," CA: A Cancer Journal for Clinicians, vol. 67, no. 1, pp. 7-30, 2017.
• S. Jones, X. Zhang, D. W. Parsons et al., "Core signaling pathways in human pancreatic cancers revealed by global genomic analyses," Science, vol. 321, no. 5897, pp. 1801-1806, 2008.
• H. Ishihara, S. Yamashita, S. Fujii, K. Tanabe, H. Mukai, T. Ushijima, "DNA methylation marker to estimate the breast cancer cell fraction in DNA samples," Medical Oncology, vol. 35, no. 11, pp. 147, 2018.

タイトルに関連する用語 (3件)： すい管腺癌 ,  エピジェネティック ,  分析