Sarabiウシにおける最近の選択署名の全ゲノム検出:ユニークなイランのタウリン品種【JST・京大機械翻訳】

Moradian Hasan; Esmailizadeh Koshkoiyeh Ali; Mohammadabadi Mohammadreza; Asadi Fozi Masood

文献

J-GLOBAL ID：202002252067755131 整理番号：20A0551652

Sarabiウシにおける最近の選択署名の全ゲノム検出:ユニークなイランのタウリン品種【JST・京大機械翻訳】

Whole genome detection of recent selection signatures in Sarabi cattle: a unique Iranian taurine breed

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資料名：
巻： 42 号： 2 ページ： 203-215 発行年： 2020年
JST資料番号： W4382A ISSN： 2092-9293 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：ドイツ (DEU) 言語：英語 (EN)

背景:選択下のゲノム領域の同定は,選択効率を増加させるために設計されたツールの開発に有用な特異的表現型の生物学のより良い理解を可能にする可能性がある。【目的】本研究の目的は,サビ牛におけるこれらの選択特徴の基礎となる対応する遺伝子とQTLを同定するために,最近の選択署名の痕跡を検出することであった。【方法】:20匹の動物からのサンプルを,Illina BoveHD BeadChipを用いて,ゲノムを横切って777,962のSNPのために遺伝子型を決定した。選択署名分析を統合ハプロタイプスコア(IHS)方法論を用いて実行した。【結果】可能な最近の選択署名の合計8つの有意領域(P<0.0001)を,BTA14とBTA17で検出した。加えて,9つの遺伝子は,KCNQ3,HHLA1,Oc90,EFR3A,ADCY8,ASAP1,TMEM132B,およびTMEM132Cのような選択特徴を持つ領域で同定された。ウシゲノムのこれらの領域における報告されたQTLの研究は,それらが乳,生殖および生産形質のような重要な形質と関連していることを示した。【結論】結果は,BTA14およびBTA17に関する陽性選択の下で,複数のゲノム領域ならびに複数の新しい遺伝子を明らかにした。さらに,ウシQTLデータベースで報告されたQTLと重複する候補選択領域は,選択下で検出された領域の有意性に対する付加的証拠を提供した。本研究は,ウシのゲノムにおける同定された推定選択特徴の詳細な分析のための基礎を提供し,特に在来および地方で開発されたウシ品種において,良く構造化された品種改良のための道を提供する。Copyright The Genetics Society of Korea 2019 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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著者キーワード (6件)： , , , , ,

遺伝子の構造と化学 , 遺伝的変異 , 飼育動物の育種

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