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J-GLOBAL ID：202002252331155912   整理番号：20A0503561

CIRCADA:教育的強調による実験的および合成的概日時系列の探索のためのSHINY APPS【JST・京大機械翻訳】

CIRCADA: Shiny Apps for Exploration of Experimental and Synthetic Circadian Time Series with an Educational Emphasis

著者 (8件)： Cenek Lisa (Mathematics and Statistics, Amherst College, Amherst, Massachusetts) ,  Klindziuk Liubou (Mathematics and Statistics, Amherst College, Amherst, Massachusetts) ,  Lopez Cindy (Mathematics and Statistics, Amherst College, Amherst, Massachusetts) ,  McCartney Eleanor (Neuroscience Program, Smith College, Northampton, Massachusetts) ,  Martin Burgos Blanca (Neuroscience Program, Smith College, Northampton, Massachusetts) ,  Tir Selma (Neuroscience Program, Smith College, Northampton, Massachusetts) ,  Harrington Mary E. (Neuroscience Program, Smith College, Northampton, Massachusetts) ,  Leise Tanya L. (Mathematics and Statistics, Amherst College, Amherst, Massachusetts)
資料名： Journal of Biological Rhythms  (Journal of Biological Rhythms)
巻： 35  号： 2  ページ： 214-222  発行年： 2020年 
JST資料番号： T0561A  ISSN： 0748-7304  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 概日リズムは生理学と行動における毎日の振動であり,体温,運動活性,または生物発光レポーターを記録することにより評価することができる。これらの異なるタイプのデータは,波形,雑音特性,典型的サンプリング速度,および記録の長さにおいて大きく変化することができる。著者らは,これらのデータの探査のための2つの新しい評価を開発し,周期と位相のような概日パラメータの可視化と解析を可能にした。方法は,離散ウェーブレット変換,正弦フィッティング,Lomb-Scargleペリオドグラム,自己相関,および最大エントロピースペクトル解析を含み,各方法が各タイプのデータに及ぼす方法の意味を与える。また,これらの方法に対する教育的概観とガイダンスを提供し,このタイプの解析に対する新しい訓練を支援した。CIRCADA-E(データ解析-実験時間シリーズのためのCircadian App)は,複数の組織から記録されたマウス体温,運動活性,およびPER2:LUCリズムを用いて大規模な実験データセットを探索することを可能にする。CIRCADA-S(データ解析合成時間シリーズのための回路)は,ユーザ指定パラメータを用いて時系列を生成し解析し,それにより,周期と位相推定の精度が雑音の種類とレベル,サンプリング速度,記録の長さ,および方法にどのように依存するかを実証した。著者らは,2つのin silico事例研究を通して,評価の潜在的利用を実証した。Copyright 2020 The Author(s) Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 生物ルミネセンス ,  *教育 ,  事例研究 ,  可視化 ,  体温 ,  雑音特性 ,  データ解析 ,  自己相関 ,  日周期 ,  スペクトル解析 ,  位相 ,  雑音
準シソーラス用語： ペリオドグラム ,  離散ウェーブレット変換 ,  サンプリング速度 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： 概日リズム ,  生物学的振動 ,  データ解析 ,  離散ウェーブレット変換 ,  ペリオドグラム ,  数理解析 ,  SHINY APP

分類 (1件)： 動物生理一般  (EJ02010E)

タイトルに関連する用語 (5件)： 教育 ,  実験 ,  時系列 ,  探索 ,  APPS