文献

J-GLOBAL ID：202002252380799019   整理番号：20A1430610

グリーン植物のための生命の木にまたがるThousand種のトランスクリプトームの配列決定と解析【JST・京大機械翻訳】

Sequencing and Analyzing the Transcriptomes of a Thousand Species Across the Tree of Life for Green Plants

著者 (11件)： Wong Gane Ka-Shu (Department of Biological Sciences and Department of Medicine, University of Alberta, Edmonton, Alberta T6G 2E9, Canada; email: [e-mail]) ,  Wong Gane Ka-Shu (BGI-Shenzhen, Beishan Industrial Zone, Yantian District, Shenzhen 518083, China) ,  Soltis Douglas E. (Florida Museum of Natural History, Gainesville, Florida 32611, USA) ,  Soltis Douglas E. (Department of Biology, University of Florida, Gainesville, Florida 32611, USA) ,  Leebens-Mack Jim (Department of Plant Biology, University of Georgia, Athens, Georgia 30602, USA) ,  Wickett Norman J. (Negaunee Institute for Plant Conservation Science and Action, Chicago Botanic Garden, Glencoe, Illinois 60022, USA) ,  Barker Michael S. (Department of Ecology and Evolutionary Biology, University of Arizona, Tucson, Arizona 85721, USA) ,  Van de Peer Yves (Department of Plant Biotechnology and Bioinformatics, VIB Center for Plant Systems Biology, Ghent University, 9052 Ghent, Belgium) ,  Van de Peer Yves (Department of Biochemistry, Genetics and Microbiology, University of Pretoria, Pretoria 0028, South Africa) ,  Graham Sean W. (Department of Botany, University of British Columbia, Vancouver, British Columbia V6T 1Z4, Canada) ,  Melkonian Michael (Faculty of Biology, University of Duisburg-Essen, D-45141 Essen, Germany)
資料名： Annual Review of Plant Biology  (Annual Review of Plant Biology)
巻： 71  ページ： 741-765  発行年： 2020年 
JST資料番号： W1764A  ISSN： 1543-5008  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 1000植物(1KP)イニシアチブは,この場合,Viridiplanaeまたは緑色植物において,生命の主要クレードに対する種の系統発生的代表サンプリングを横断して次世代シークエンシング(NGS)データを収集する最初の大規模努力であった。国際多分野共同体として,著者らは植物進化とその実用的含意に焦点を当てた。主要な成果の中で,低コピー遺伝子の系統学的分析による緑色植物に対する参照種樹木の推論,Viridiplanaeの古多倍数性(全ゲノム重複)の調査,多くの遺伝子ファミリーと生物学的過程に対する推定進化史,哺乳類神経科学における光遺伝学的研究に対する新規光感受性蛋白質の発見,および複合形質(C_4光合成)に対する遺伝的ネットワークの解明が,得られた。要するに,1KPは,生命の木を横断して,完全なde novoゲノムを含むより多くのデータを生成することを狙った将来のプロジェクトのためのテンプレートを提供する,系統多様性配列データセットからどのように価値を抽出できるかを示した。Copyright 2020 Annual Reviews All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  光合成 ,  タンパク質 ,  哺乳類 ,  系統発生 ,  ゲノム ,  神経科学 ,  遺伝子重複 ,  含意 ,  *トランスクリプトーム
準シソーラス用語： 多倍数性 ,  クレード ,  遺伝子ファミリー ,  進化史 ,  次世代シークエンシング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 系統ゲノミクス ,  古倍数性 ,  遺伝子ファミリーの拡大 ,  バイオプロスペクティング ,  遺伝子ネットワーク

分類 (4件)： 細胞生理一般  (EF02010S) ,  細胞構成体の機能  (EF03060C) ,  光合成  (EB10020I) ,  生物学的機能  (EB03040U)

タイトルに関連する用語 (6件)： グリーン ,  植物 ,  生命 ,  木 ,  トランスクリプトーム ,  解析