文献

J-GLOBAL ID：202002252734490190   整理番号：20A2498526

環境DNAによる沿岸域魚類の網羅的な推定と多様性評価

Environmental DNA metabarcoding and diversity analysis for the fish community in coastal areas

著者 (5件)： 細川真也 (海上・港湾・航空技術研 港湾空港技研) ,  百田恭輔 (海上・港湾・航空技術研 港湾空港技研) ,  百田恭輔 (海洋生物環境研) ,  大倉翔太 (海上・港湾・航空技術研 港湾空港技研) ,  小室隆 (海上・港湾・航空技術研 港湾空港技研)
資料名： 港湾空港技術研究所資料(CD-ROM)  (Technical Note of the Port and Airport Research Institute (CD-ROM))
号： 1373  ページ： ROMBUNNO.1373  発行年： 2020年06月 
JST資料番号： F0375B  ISSN： 2436-035X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： 環境中に漂うDNAの検出によって生物の生息域を推定する技術(以下,環境DNA分析)の開発が進んでいる.魚類を網羅的に推定する環境DNA分析は,実務への応用が期待されるが,他の海域との相互作用があり,かつ,河川や人間活動の影響を強く受ける沿岸域では,環境DNA分析によりどこまで生物の生息域の推定に有効なのか未知な点が多い.本研究では,種の識別能力と再現性が高く,魚類を網羅的に推定できるMiFishプライマーセットに着目し,沿岸域における推定精度の把握と港湾分野における魚類調査への応用の可能性の検証を行った.沿岸域における推定精度の把握では,直接的な方法との比較による推定能力を評価し,さらに,注意点の抽出を行った.この結果,環境DNA分析は高い精度で魚類の分布を推定できるものの,分析者による検出力及び同定精度に差があることと河川や人間活動に由来した環境DNAを検出してしまう等の過剰な推定があることが注意点として挙げられた.魚類調査への応用に関して,環境DNA分析によって推定された結果から種数と種組成の比較が可能かどうか検証した結果,抽出された注意点がこれらの比較に影響するものの,その影響は回避できることが示された.また,種数と種組成の比較に必要となる空間距離とサンプル数についても検証した.本研究で整理された知見は,環境DNA分析技術を用いた港湾分野の魚類調査計画の立案や解析手法の選択に貢献するものと考えられる.(著者抄録)

シソーラス用語： *DNA【核酸】 ,  *沿岸 ,  *魚類 ,  生物相 ,  生物多様性 ,  測定データ ,  予測誤差 ,  生物学的比較 ,  空間分布 ,  サンプルの大きさ ,  プライマー【遺伝】 ,  *生息分布 ,  河川 ,  人間行動 ,  海洋調査 ,  組成 ,  *環境DNA ,  魚種組成
準シソーラス用語： 標本数 ,  種数

分類 (2件)： 動物生態学一般  (EE03010W) ,  海岸工学  (RC13000X)

引用文献 (49件)：

• 環境DNA学会: 環境DNA調査・実験マニュアル ver. 2.2, 2020.
• Ficetola GF, Miaud C, Pompanon F, Taberlet P: Species detection using environmental DNA from water samples. Biol Lett 4: 423-425, 2008.
• Tsuji S, Takahara T, Doi H, Shibata N: The detection of aquatic macroorganisms using environmental DNA analysis-A review of methods for collection, extraction, and detection. Environmental DNA 1: 99-108, 2019.
• Minamoto T, Yamanaka H, Takahara T, Honjo MN, Kawabata Z: Surveillance of fish species composition using environmental DNA. Limnology 13: 193-197,2012.
• Thomsen PF, Kielgast J, Iversen LL, Møller PR, Rasmussen M, Willerslev E: Detection of a diverse marine fish fauna using environmental DNA from seawater samples. PLoS ONE 7: e41732, 2012.

タイトルに関連する用語 (6件)： 環境DNA ,  沿岸域 ,  魚類 ,  推定 ,  多様性 ,  評価