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J-GLOBAL ID：202002252825697367   整理番号：20A0975057

ハマグリCyclina sinensisにおける糞便DNA単離と分解:保存と遺伝的評価のための非侵襲的DNA単離【JST・京大機械翻訳】

Fecal DNA isolation and degradation in clam Cyclina sinensis : noninvasive DNA isolation for conservation and genetic assessment

著者 (16件)： Zhang Min (Jiangsu Key Laboratory of Marine Biotechnology, Jiangsu Ocean University, Lianyungang, China) ,  Wei Min (Jiangsu Key Laboratory of Marine Biotechnology, Jiangsu Ocean University, Lianyungang, China) ,  Wei Min (Co-Innovation Center of Jiangsu Marine Bio-industry Technology, Jiangsu Ocean University, Lianyungang, China) ,  Dong Zhiguo (Jiangsu Key Laboratory of Marine Biotechnology, Jiangsu Ocean University, Lianyungang, China) ,  Dong Zhiguo (Co-Innovation Center of Jiangsu Marine Bio-industry Technology, Jiangsu Ocean University, Lianyungang, China) ,  Duan Haibao (Jiangsu Key Laboratory of Marine Biotechnology, Jiangsu Ocean University, Lianyungang, China) ,  Mao Shuang (Jiangsu Key Laboratory of Marine Biotechnology, Jiangsu Ocean University, Lianyungang, China) ,  Feng Senlei (Jiangsu Key Laboratory of Marine Biotechnology, Jiangsu Ocean University, Lianyungang, China) ,  Li Wenqian (Jiangsu Key Laboratory of Marine Biotechnology, Jiangsu Ocean University, Lianyungang, China) ,  Sun Zepeng (Jiangsu Key Laboratory of Marine Biotechnology, Jiangsu Ocean University, Lianyungang, China) ,  Li Jiawei (Jiangsu Key Laboratory of Marine Biotechnology, Jiangsu Ocean University, Lianyungang, China) ,  Yan Kanglu (Jiangsu Key Laboratory of Marine Biotechnology, Jiangsu Ocean University, Lianyungang, China) ,  Liu Hao (Jiangsu Key Laboratory of Marine Biotechnology, Jiangsu Ocean University, Lianyungang, China) ,  Meng Xueping (Jiangsu Key Laboratory of Marine Biotechnology, Jiangsu Ocean University, Lianyungang, China) ,  Ge Hongxing (Jiangsu Key Laboratory of Marine Biotechnology, Jiangsu Ocean University, Lianyungang, China) ,  Ge Hongxing (Co-Innovation Center of Jiangsu Marine Bio-industry Technology, Jiangsu Ocean University, Lianyungang, China)
資料名： BMC Biotechnology (Web)  (BMC Biotechnology (Web))
巻： 19  号： 1  ページ： 1-8  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7348A  ISSN： 1472-6750  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 保存と遺伝的評価のための破壊的サンプリングを避けるために,著者らはそれらの糞便からハマグリCyclinasinensisのDNAを分離した。DNA電気泳動とPCR増幅を用いて,糞便DNAの品質を測定した。そして,糞便と糞便DNAの分解に及ぼす種々の条件の影響を分析した。明確な糞便DNAバンドは電気泳動により検出され,鋳型としてハマグリ糞便DNAを用いたPCR増幅は効果的で信頼性があり,クラム糞便が非侵襲的DNA分離の理想的な材料として使用できることを示唆した。さらに,糞便及び糞便DNAの分解に及ぼす異なる環境温度及び浸漬時間の影響を分析することにより,最適温度は4°Cであることを見出した。15日で,糞便は良好なテクスチャーを維持し,糞便DNAの品質は良好であった。28°Cで,糞便は5日で分解し,糞便DNAの品質は悪かった。クラム糞便は,非侵襲的DNA分離のための理想的な材料として用いることができる。さらに,糞便DNAの品質は,環境温度および浸漬時間と負に相関した。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 電気泳動 ,  信頼性 ,  *DNA【核酸】 ,  単離 ,  PCR法 ,  環境温度 ,  最適温度 ,  DNA分離
準シソーラス用語： *非侵襲 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： Cyclina sinensis ,  糞便;非侵襲的DNA単離 ,  DNA分解

分類 (3件)： 微生物検査法  (EG02020G) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  遺伝学研究法  (EC01020N)

引用文献 (49件)：

• J Mar Syst; Effects of filter-feeding bivalves on the distribution of water quality and nutrient cycling in a eutrophic coastal lagoon; Y Nakamura, F Kerciku; 26; 2000; 209-221; 10.1016/S0924-7963(00)00055-5; citation_id=CR1
• Chin J Oceanol Limnol; Effects of clam size, food type, sediment characteristic, and seawater carbonate chemistry on grazing capacity of Venus clam Cyclina sinensis (Gmelin, 1791); TT Lin, K Zhou, X Liu, QF Lai, D Zhang, LY Shi; 35; 2016; 1239-1247; 10.1007/s00343-017-5334-z; citation_id=CR2
• Trends Ecol Evol; Noninvasive genetic sampling: look before you leap; P Taberlet, LP Waits, G Luikart; 14; 2008; 323-327; 10.1016/S0169-5347(99)01637-7; citation_id=CR3
• Acta Genet Sin; Study on sequences of ribosomal DNA internal transcribed spacers of clams belonging to the Veneridae Family (Mollusca: Bivalvia); HL Cheng, DQ Xia, TT Wu, XP Meng, HJ Ji, ZG Dong; 33; 8; 2006; 702-710; 10.1016/S0379-4172(06)60102-9; citation_id=CR4
• Morin PA, Woodruff DS. Noninvasive genotyping for verteb rate conservation. Mol Genet Approaches Conserv. 1996. p. 298-313.

タイトルに関連する用語 (8件)： ハマグリ ,  糞便 ,  DNA ,  単離 ,  分解 ,  保存 ,  遺伝的評価 ,  非侵襲的