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J-GLOBAL ID：202002253548429439   整理番号：20A1734067

新規で単純な遺伝子不活性化法としての非相同末端結合経路による単一相同性アーム線形DNA組換:Dietzia sp.株DQ12-45-1bにおける概念実証研究【JST・京大機械翻訳】

Single-Homology-Arm Linear DNA Recombination by the Nonhomologous End Joining Pathway as a Novel and Simple Gene Inactivation Method: a Proof-of-Concept Study in Dietzia sp. Strain DQ12-45-1b

著者 (7件)： Lu Shelian ,  Nie Yong ,  Wang Meng ,  Xu Hong-Xiu ,  Ma Dong-Ling ,  Liang Jie-Liang ,  Wu Xiao-Lei
資料名： Applied and Environmental Microbiology  (Applied and Environmental Microbiology)
巻： 84  号： 19  ページ： Null  発行年： 2018年 
JST資料番号： A0427A  ISSN： 0099-2240  CODEN： AEMIDF  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ABSTRACT非相同末端結合(NHEJ)は二本鎖切断修復におけるその役割のためゲノム安定性に重要である。KuとリガーゼD(LigD)はこの過程で重要な蛋白質であり,KuとLigDを発現する株はin vivoで線形DNAを環化できる。ここでは,NHEJによるin vivoでの線形DNAの環化が非複製可能な環状DNAの生成に使用可能であり,環状DNAと染色体間の対立遺伝子交換を可能にする,遺伝子不活性化またはゲノム編集のための概念実証単一相同-腕線形DNA組換えを確立した。KuおよびLigD相同体を発現し,NHEJ活性を示す,Detzia sp.DQ12-45-1bにおけるこの方法を達成した。染色体の配列に線形DNA単一相同体で菌株を形質転換することにより,ゲノムを変異させた。この方法は適切なプラスミドのスクリーニングを必要とせず,容易かつ時間効率であった。バイオインフォマティクス分析は,原核生物の20%以上がKuとLigDを含み,NHEJ活性の広い分布を示唆する。さらに,Escherichia coli株も,Detzia sp.DQ12-45-1bのKuとLigDが導入され,発現したとき,NHEJ活性を示した。したがって,この方法は多様な原核生物,特に非モデル微生物のための広く適用可能なゲノム編集ツールである。IMPORTANCEは多くの非モデルグラム陽性細菌は効率的な遺伝子操作システムを欠くが,KuとLigDをコードする遺伝子を発現する。Diedizia sp.DQ12-45-1bにおけるNHEJ経路を評価し,ゲノムにおける11の遺伝子を成功裏にノックアウトするために使用した。バイオインフォマティクス研究は,KuとLigDをコードする推定遺伝子が系統発生的に多様な細菌と古細菌に偏在的に存在することを明らかにしたので,NHEJ経路による単一相同-腕線形DNA組換えは,多様な非モデル原核生物のための潜在的に適用可能な遺伝子操作法であった。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 大腸菌 ,  *DNA【核酸】 ,  *遺伝子 ,  染色体 ,  タンパク質 ,  ゲノム ,  環化反応 ,  プラスミド ,  対立遺伝子 ,  原核生物 ,  *単相 ,  古細菌 ,  *DNA組換
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス ,  *非相同末端結合 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 遺伝子操作  (EC02050B)

タイトルに関連する用語 (9件)： 遺伝子不活性化 ,  非相同末端結合 ,  経路 ,  相同性 ,  線形 ,  DNA組換 ,  Dietzia ,  株 ,  概念実証研究