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J-GLOBAL ID：202002254676241362   整理番号：20A2421724

バイオインフォマティクス分析による肝癌転移の代謝特徴【JST・京大機械翻訳】

Metabolic characteristics analysis of liver cancer metastasis using bioinformatics

著者 (3件)： Zhao Dan (中国医学科学院基礎医学研究所 医学分子生物学国家重点実験室,北京 100005) ,  Li Li (中国医学科学院基礎医学研究所 医学分子生物学国家重点実験室,北京 100005) ,  Du Wenjing (中国医学科学院基礎医学研究所 医学分子生物学国家重点実験室,北京 100005)
資料名： Guoji Wai Kexue Zazhi  (Guoji Wai Kexue Zazhi)
巻： 47  号： 5  ページ： 338-341,f3  発行年： 2020年 
JST資料番号： C3940A  ISSN： 1673-4203  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的:バイオインフォマティクス分析法を用いて、insitu肝癌と転移病巣における差異遺伝子及びその関与の代謝経路を選別し、肝癌転移治療の新しい代謝標的を探す。方法:遺伝子発現アセンブリデータベース(GEO)からダウンロード番号はGSE40367の肝癌原発と転移遺伝子発現プロファイルデータである。遺伝子オントロジー(GO)の機能的濃縮とゲノム(KEGG)の経路解析を,遺伝子オントロジー(GO)の機能的濃縮と遺伝子オントロジー(KEGG)によって実施した。STRINGデータベースとcytoscapeソフトウェアを用いて差異遺伝子間の蛋白質相互作用を分析した。文献検索により肝癌転移における代謝群の変化を得,差異遺伝子と代謝物をMetaboAnalyst4.0で共同分析した。Kaplan-Meier生存曲線を用いて,キー遺伝子を生存した。結果:GSE40367から全部で564個の差異遺伝子を選別し、原位置腫瘍に比べ、転移癌では287個、ダウンレギュレーション遺伝子は277個であった。差異遺伝子GOの機能は一元カルボン酸代謝、脂肪酸代謝と脂質輸送などのプロセスに富んでいる。KEGGは主に胆汁分泌、ABCトランスポーター、システインとメチオニン代謝及び糖新生などの経路に濃縮される。連合分析により、主要関連代謝経路はニコチン酸とニコチンアミド代謝、フェニルアラニン代謝、アルギニン生合成と解糖或いは糖異生などであることが明らかになった。鍵となる遺伝子の生存分析で、CTH遺伝子の低発現は肝癌の不良予後と相関があり、PCK1、AOX1遺伝子の高発現は肝癌の不良予後と関係がある可能性がある。結論:バイオインフォマティクス分析を用いて、肝癌転移に関連する代謝経路及び経路における遺伝子と代謝物の変化を明らかにし、肝癌転移発生の分子機構を提示し、肝癌転移治療に新たな代謝標的を提供した。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  遺伝子 ,  代謝産物 ,  代謝経路 ,  ソフトウェア ,  *腫瘍転移 ,  予後 ,  遺伝子発現 ,  *肝臓腫瘍 ,  ダウンレギュレーション ,  ABC輸送体 ,  脂肪族アミン ,  スルフィド ,  脂肪族カルボン酸 ,  含硫アミノ酸 ,  第一アミン ,  アミノ酸
準シソーラス用語： *バイオインフォマティクス ,  遺伝子オントロジー , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (4件)： 生薬の薬理の基礎研究  (GX06020J) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

物質索引 (2件)： メチオニン ,  アルギニン

タイトルに関連する用語 (4件)： バイオインフォマティクス ,  分析 ,  肝癌 ,  代謝