抄録/ポイント:
抄録/ポイント
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細菌の存在と植物と動物生物学の側面を持つ遺伝子を含むABSTRACTは,自然に発生するシンビオースの機能的特性化を急速に排除する。機構的研究に対する主要な障壁は,野生および多様な細菌分離株の効率的な遺伝子操作のためのツールの欠如である。改良された分子ツールの必要性に取り組むために,著者らは,系統を横断して遺伝子ノックアウトおよびノックアウト手順を促進する一連の近代化ベクターを構築するために,テストベッドとしてゼブラフィッシュ腸微生物叢に固有なプロテオバクテリア分離株の収集を使用した。著者らが導入した革新は,従来の遺伝的技術の柔軟性を高め,単一セットのツールで多くの異なる細菌分離株を操作することを容易にする。馴化フリー共役のための代替戦略を開発し,カスタマイズ可能な特徴を有するプラスミドを設計し,相同組換えの視覚マーカーを用いて,対立遺伝子交換を流線した。ゼブラフィッシュ腸内の細菌挙動の比較研究により,これらのツールの可能性を実証した。蛍光標識分離株のライブイメージングは,それらの生物地理と優勢な成長モード(すなわちプランクトン対凝集)が異なる個体群構造のスペクトルを明らかにした。最も著しいのは,多様な遺伝子型-表現型関係を観察した:ゲノム解析により予測されるいくつかの分離株と鞭毛運動能を持つin vitroアッセイは,生きた宿主内でこの形質を示さない。まとめると,本研究で生成したツールは,野生および多様な細菌系統の機能的特性化のための新たな資源を提供し,それは,配列決定に基づく相関から機構的基礎への研究パイプラインのスピードを助けるであろう。微生物相研究におけるIMPORTANCEAの大きな挑戦は,植物と動物の生命に影響する能力を有する共生細菌の大きな多様性である。共生細菌が宿主の生物学に影響する細胞及び分子メカニズムを定義するための相関DNA配列決定に基づく研究を超える移動は,新規及び非特性化細菌分離株の遺伝子操作が遅く,現在の遺伝的ツールで困難であるので,失速である。さらに,de novo開発ツールは,無害で時間のかかるタスクであり,従って,進歩への有意な障壁を表す。この問題に取り組むために,著者らは,ポスト共役対選択,モジュール性,および対立遺伝子交換を改善することによって,従来の遺伝的技術を流線する一連の工学ベクターを開発した。著者らの近代化ツールとステップバイステッププロトコルは,細菌共生の確立されたモデルと新たに出現したモデルの両方の内部作業を研究する研究者を電力化する。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】