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J-GLOBAL ID：202002254745137835   整理番号：20A2757432

原発性開放隅角緑内障に関連するlncRNA-miRNA-mRNA調節ネットワークの同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of lncRNA-miRNA-mRNA regulatory network associated with primary open angle glaucoma

著者 (10件)： Zhou Minwen (Department of Ophthalmology, Shanghai General Hospital (Shanghai First People’s Hospital), Shanghai Jiao Tong University School of Medicine, Shanghai, China) ,  Zhou Minwen (National Clinical Research Center for Eye Diseases, Shanghai, China) ,  Zhou Minwen (Shanghai Key Laboratory of Fundus Diseases, Shanghai, China) ,  Lu Bing (Department of Ophthalmology, Shanghai General Hospital (Shanghai First People’s Hospital), Shanghai Jiao Tong University School of Medicine, Shanghai, China) ,  Lu Bing (National Clinical Research Center for Eye Diseases, Shanghai, China) ,  Lu Bing (Shanghai Key Laboratory of Fundus Diseases, Shanghai, China) ,  Tan Wei (The Department of Ophthalmology, The Third Affiliated Hospital of Zunyi Medical University, Zunyi, China) ,  Fu Mingshui (Department of Ophthalmology, Shanghai General Hospital (Shanghai First People’s Hospital), Shanghai Jiao Tong University School of Medicine, Shanghai, China) ,  Fu Mingshui (National Clinical Research Center for Eye Diseases, Shanghai, China) ,  Fu Mingshui (Shanghai Key Laboratory of Fundus Diseases, Shanghai, China)
資料名： BMC Ophthalmology (Web)  (BMC Ophthalmology (Web))
巻： 20  号： 1  ページ： 1-9  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7442A  ISSN： 1471-2415  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 原発性開放角緑内障(POAG)は網膜神経節細胞(RGC)死の進行性永久変性を特徴とする多因子障害である。多くの研究は,長い非コードRNA(lncRNA)が遺伝子発現を調節する能力を持つことを示唆した。しかし,これまで,POAGの発症におけるlncRNAの機構と機能はまだ不明である。遺伝子発現Omnibus(GEO)からのデータを用いて,POAG患者と対照の間で差次的に発現したlncRNAと差次的に発現したmRNAを同定した。次に,lncRNA-miRNA-mRNA競合内因性RNA(ceRNA)ネットワークを構築し,POAGにおける重要なlncRNAを同定した。遺伝子オントロジー(GO)分析と遺伝子およびゲノム(KEGG)経路分析の京都エンシクロペディアを,ceRNAネットワークにおけるmRNAの豊富な生物学的機能を評価するために実施した。本研究では,37のmiRNAノード,248のlncRNAノード,178のmRNAノード,および1985のエッジを有するPOAG関連ceRNAネットワークを構築した。加えて,4つのlncRNA(DNAJC27-AS1,AF121898,OIP5-AS1,およびSNX29P2)を,このceRNAネットワークにおけるハブRNAとして確立した。機能分析は,18のGO項と17の経路が豊富であることを示した。本研究はPOAGにおけるlncRNA関連ceRNAネットワークへの新規洞察を提供し,4つのlncRNAをPOAGの発生において同定した。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ネットワーク ,  *RNA【核酸】 ,  *mRNA ,  遺伝子 ,  死 ,  生物活性 ,  機能分析 ,  遺伝子発現
準シソーラス用語： *マイクロRNA ,  非翻訳RNA ,  内因性 ,  *遺伝子調節ネットワーク ,  遺伝子オントロジー ,  KEGG ,  *非翻訳長鎖RNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： 原発性開放隅角緑内障 ,  長鎖非コードRNA ,  lncRNA-miRNA-mRNA調節ネットワーク

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (46件)：

• Eye (Lond); Primary open-angle glaucoma genes; JH Fingert; 25; 5; 2011; 587-595; 10.1038/eye.2011.97; citation_id=CR1
• Exp Eye Res; Molecular genetics in glaucoma; Y Liu, RR Allingham; 93; 4; 2011; 331-339; 10.1016/j.exer.2011.08.007; citation_id=CR2
• Ophthalmology; Prevalence, awareness, and risk factors of primary open-angle glaucoma: Korea National Health and nutrition examination survey 2008-2011; KE Kim, MJ Kim, KH Park, JW Jeoung, SH Kim, CY Kim; 123; 3; 2016; 532-541; 10.1016/j.ophtha.2015.11.004; citation_id=CR3
• BMC Public Health; Prevalence, incidence, and risk factors of primary open-angle glaucoma - a cohort study based on longitudinal data from a German public health insurance; D Kreft, G Doblhammer, RF Guthoff, S Frech; 19; 1; 2019; 851; 10.1186/s12889-019-6935-6; citation_id=CR4
• Jama Ophthalmol; The prevalence and types of glaucoma in an urban Chinese population: the Singapore Chinese eye study; M Baskaran, RC Foo, CY Cheng, AK Narayanaswamy, YF Zheng, R Wu; 133; 8; 2015; 874-880; 10.1001/jamaophthalmol.2015.1110; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (6件)： 原発性開放隅角緑内障 ,  lncRNA ,  miRNA ,  mRNA ,  調節ネットワーク ,  同定