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J-GLOBAL ID：202002255414619449   整理番号：20A0673042

Prame陽性乳癌に対する免疫原性構築物を設計するための免疫ペプチドスクリーニング in silico研究【JST・京大機械翻訳】

Immunopeptidome screening to design An immunogenic construct against PRAME positive breast cancer; An in silico study

著者 (4件)： Afzali Farzaneh (Department of Oncology, Faculty of Medicine and Dentistry, University of Alberta, Edmonton, Canada) ,  Minuchehr Zarrin (Systems Biotechnology Department, National Institute of Genetic Engineering and Biotechnology (NIGEB), Tehran, Iran) ,  Jahangiri Samira (Department of Molecular Medicine, Morsani College of Medicine, University of South Florida, FL, United States of America) ,  Ranjbar Mohammad Mehdi (Razi Vaccine and Serum Research Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran)
資料名： Computational Biology and Chemistry  (Computational Biology and Chemistry)
巻： 85  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： H0201B  ISSN： 1476-9271  CODEN： COCHDK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 転移は乳癌(BC)致死の主な原因であり,特に初期段階では治療法の改善をもたらす。最近,生物学的プロセスと免疫系の認識の改善により,ワクチンの新しいクラスが望まれる抗原に対する分解能構築物の設計の機会を提供することが明らかにされている。本研究では,BCを含む様々なヒト癌に対する癌精巣抗原として計数されているMelanoma(PRAME)に対する新しい癌ワクチンを設計するために,種々の免疫情報学ツールを用いた。PRAMEアップレギュレーションは,癌細胞におけるBC幹細胞維持,薬物耐性,細胞生存,適応およびアポトーシス回避を強化する。PRAME共発現遺伝子は,TCGAデータのBC RNA塩基配列決定を通してマイニングされ,検証された。免疫優性T細胞予測エピトープを融合し,ワクチンを形成するために操作した。ワクチンの安全性,アレルゲン性および免疫原性能力を有望な免疫情報科学ツールにより確認した。ワクチンの構造は,KyteとDoolittleの疎水性プロットを通してほとんどの領域で親水性であることが確認された。TLR4とIL1Rの設計されたワクチンと免疫受容体の間の相互作用は,その三次構造をモデル化した後に,蛋白質-蛋白質ドッキングによって確認された。最後に,コドン最適化とin silicoクローニングを行い,より良いin vivo結果を保証した。結論として,本研究におけるin silico評価の結果に関して,設計されたワクチンはPRAMEに対する免疫応答を潜在的に促進することができ,したがってBCの発生と転移を減少させる可能性がある。mined PRAME共発現遺伝子とそれらの機能的アノテーションによると,細胞周期調節は,この構築物とその隣接する免疫反応に沿った調節遺伝子により選択される主要な機構である。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： タンパク質 ,  ワクチン ,  ヌクレオチド配列 ,  免疫反応 ,  疎水性 ,  T細胞 ,  腫瘍細胞 ,  *乳房腫瘍 ,  エピトープ ,  RNA【核酸】 ,  アップレギュレーション ,  アポトーシス ,  精巣 ,  情報科学 ,  ヒト

著者キーワード (6件)： 抗原性 ,  ワクチン ,  PRME ,  バイオインフォマティクス ,  ネットワーク ,  細胞周期

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (8件)： 乳癌 ,  免疫原性 ,  構築物 ,  設計 ,  免疫 ,  ペプチド ,  スクリーニング ,  研究