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J-GLOBAL ID：202002255642974106   整理番号：20A1955905

VD解析:疾患進行を分析するための動的ネットワークフレームワーク【JST・京大機械翻訳】

VD-Analysis: A Dynamic Network Framework for Analyzing Disease Progressions

著者 (3件)： Fan Xuemeng (School of Science, Jiangnan University, Wuxi, China) ,  Zhu Ping (School of Science, Jiangnan University, Wuxi, China) ,  Tang Xu-Qing (School of Science, Jiangnan University, Wuxi, China)
資料名： IEEE Access  (IEEE Access)
巻： 8  ページ： 153202-153214  発行年： 2020年 
JST資料番号： W2422A  ISSN： 2169-3536  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 疾患の進行はゲノム活性の変化と関連するが,臨床応用のための遺伝子バイオマーカーのスクリーニングの課題となっている。動的ネットワーク法(DNM)における疾患進行は,各フレームが時変遺伝子-遺伝子相互作用ネットワークの一時的状態を表す離散フレームから成るアニメートフィルムと類似している。主な不足は,2つの隣接一時的状態間の遷移が調査を超えていることである。ここでは,VD解析後に命名された最新の計算方法論を開発した。単一遺伝子バイオマーカーは複雑な生物学的プロセスを表すことができなかったので,まず,V-構造を3つの遺伝子から成る遺伝子モジュールと,それらの間の2つの相互作用と,ユニットモジュールとして定義する。次に,疾患進行をマークする摂動経路を同定し,経路摂動を駆動するV構造を同定した。このようなドライバV構造は,臨床応用のための適格なバイオマーカーとして採用できる。この方法の実現可能性を試験するために,マウスII型糖尿病(T2D)に関連する遺伝子発現の経時変化データセットに適用した。結果は,T2Dの全プロセスが3つの段階に正確に分割され,各ステージで推論されたドライバV構造が,認定されたバイオマーカーであることを示した。要約すると,著者らの方法は動的疾患進行の記述に寄与し,V-構造バイオマーカーは疾患の治療を促進する。Copyright 2020 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  *ネットワーク ,  遺伝子 ,  経時変化 ,  ゲノム ,  計算理論 ,  摂動 ,  遺伝子発現 ,  2型糖尿病 ,  バイオマーカー
準シソーラス用語： *疾患進行 ,  *動的ネットワーク ,  臨床応用 ,  遺伝子相互作用 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  遺伝学研究法  (EC01020N) ,  音声処理  (JE05000E)

タイトルに関連する用語 (6件)： Vd ,  解析 ,  疾患進行 ,  分析 ,  動的ネットワーク ,  フレームワーク