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J-GLOBAL ID：202002255773564758   整理番号：20A0031014

グリコサミノグリカンMS/MSデータの自動解析のためのスコアリングアルゴリズム【JST・京大機械翻訳】

A Scoring Algorithm for the Automated Analysis of Glycosaminoglycan MS/MS Data

著者 (3件)： Duan Jiana (Department of Chemistry, University of Georgia, Athens, GA, USA) ,  Pepi Lauren (Department of Chemistry, University of Georgia, Athens, GA, USA) ,  Amster I. Jonathan (Department of Chemistry, University of Georgia, Athens, GA, USA)
資料名： Journal of the American Society for Mass Spectrometry  (Journal of the American Society for Mass Spectrometry)
巻： 30  号： 12  ページ： 2692-2703  発行年： 2019年 
JST資料番号： W0174A  ISSN： 1044-0305  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 主な生物学的機能におけるグリコサミノグリカン(GAGs)の役割は多数で多様であるが,質量分析技術によるそれらの構造特性化は挑戦的であることが証明されている。タンデム質量分析からのGAG構造の特性化は面倒で時間のかかるプロセスであるが,遺伝的アルゴリズムを実行するソフトウェアの支援を通して,データベースに依存しないハイスループット様式で自動化することができる(J.Am.29,1802~1911,2018)。本研究では,このデータがソフトウェアにより解釈される方法を示し,特にスコアリングアルゴリズムの開発に取り組んだ。グリコシド及び交差環フラグメントイオンの重要性及び修飾の位置を割り当てるための特異的フラグメントが提供する意味を論じた。品質に対する基準として広く受け入れられている期待値を用いて,統計的長所に対する評価アルゴリズムを試験した。良く特性化された標準に対するMS/MSデータを用いて,このスコアリング手法は,割り当てられた構造がランダムな機会によりデータに適合するという低い尤度(10~12の機会で1)を持つ正しい構造を割り当てることを示した。構造割当を自動化する統合ソフトウェアは,Glycosan-Uiguous Identification Technology(G-Unit)と呼ばれている。Copyright 2019 American Society for Mass Spectrometry Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： タンデム質量分析 ,  キャラクタリゼーション ,  *グリコサミノグリカン ,  データベース ,  *アルゴリズム ,  質量分析 ,  期待値 ,  遺伝的アルゴリズム ,  ソフトウェア ,  アメリシウム ,  グリコシド ,  自動化 ,  生物活性 ,  品質
準シソーラス用語： *スコア化 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： グリコサミノグリカン ,  Fourier変換質量分析 ,  自動化 ,  ソフトウェア ,  自動データ解析

分類 (2件)： 質量分析  (CC03013N) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

タイトルに関連する用語 (2件)： グリコサミノグリカン ,  解析