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J-GLOBAL ID：202002256043832419   整理番号：20A1117164

符号化蛋白質キナーゼ調節回路の予測【JST・京大機械翻訳】

Prediction of Signed Protein Kinase Regulatory Circuits

著者 (9件)： Invergo Brandon M. (European Molecular Biology Laboratory-European Bioinformatics Institute, Hinxton CB10 1SD, UK) ,  Petursson Borgthor (European Molecular Biology Laboratory-European Bioinformatics Institute, Hinxton CB10 1SD, UK) ,  Akhtar Nosheen (Centre for Genomics and Computational Biology, Queen Mary University of London, London EC1M 6BQ, UK) ,  Bradley David (European Molecular Biology Laboratory-European Bioinformatics Institute, Hinxton CB10 1SD, UK) ,  Giudice Girolamo (European Molecular Biology Laboratory-European Bioinformatics Institute, Hinxton CB10 1SD, UK) ,  Hijazi Maruan (Centre for Genomics and Computational Biology, Queen Mary University of London, London EC1M 6BQ, UK) ,  Cutillas Pedro (Centre for Genomics and Computational Biology, Queen Mary University of London, London EC1M 6BQ, UK) ,  Petsalaki Evangelia (European Molecular Biology Laboratory-European Bioinformatics Institute, Hinxton CB10 1SD, UK) ,  Beltrao Pedro (European Molecular Biology Laboratory-European Bioinformatics Institute, Hinxton CB10 1SD, UK)
資料名： Cell Systems  (Cell Systems)
巻： 10  号： 5  ページ： 384-396.e9  発行年： 2020年 
JST資料番号： W3087A  ISSN： 2405-4712  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 蛋白質キナーゼ間の調節関係の複雑なネットワークは細胞内シグナル伝達の主要成分を構成する。多くのキナーゼ-キナーゼ調節関係は詳細に記述されているが,これらは良く研究されたキナーゼに限られている傾向があるが,可能な関係の大部分は探索されていない。ここでは,ヒトキナーゼキナーゼ調節関係を予測するためのデータ駆動,教師つき機械学習法,およびそれらが活性化または阻害効果を有するかどうかを検討した。ハイスループットデータ,キナーゼ特異性プロファイル,および構造情報を組み込み,著者らの予測を作成した。結果は,以前に注釈された調節関係をうまく再現し,地上から既知のシグナル伝達経路を再構築することができる。予測の完全なネットワークは比較的まばらで,多くの関係が低い確率を割り当てた。しかし,細胞内シグナル伝達研究において通常考慮されているよりも,キナーゼ間調節の高密度モードを示唆する。本論文の透明なピアレビュープロセスの記録を含めた。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ネットワーク ,  リン酸化 ,  *タンパク質キナーゼ ,  再構成 ,  制御回路 ,  機械学習
準シソーラス用語： ハイスループット ,  特異性 ,  伝達経路 ,  *キナーゼ ,  細胞内シグナル伝達 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 蛋白質キナーゼ ,  リン酸化 ,  細胞内シグナル伝達 ,  機械学習 ,  シグナリングネットワーク

分類 (1件)： 細胞生理一般  (EF02010S)

タイトルに関連する用語 (4件)： 符号化 ,  蛋白質キナーゼ ,  調節回路 ,  予測