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J-GLOBAL ID：202002256493650167   整理番号：20A0884946

ユニークな特性を持つ高度に関連した病原性Clostridium difficileクレードの最近の出現【JST・京大機械翻訳】

The recent emergence of a highly related virulent Clostridium difficile clade with unique characteristics

著者 (21件)： Shaw H.A. (Department of Pathogen Molecular Biology, London School of Hygiene and Tropical Medicine, London, UK) ,  Shaw H.A. (Division of Bacteriology, National Institute for Biological Standards and Controls, South Mimms, Potters Bar, UK) ,  Preston M.D. (Department of Pathogen Molecular Biology, London School of Hygiene and Tropical Medicine, London, UK) ,  Preston M.D. (Analytical Biological Service Division, National Institute for Biological Standards and Controls, Potters Bar, UK) ,  Vendrik K.E.W. (National Reference Laboratory for CDI Surveillance, Department of Medical Microbiology and RIVM, Leiden University Medical Centre, Leiden, the Netherlands) ,  Cairns M.D. (Department of Pathogen Molecular Biology, London School of Hygiene and Tropical Medicine, London, UK) ,  Cairns M.D. (Public Health Laboratory London, Division of Infection, The Royal London Hospital, London, UK) ,  Browne H.P. (Wellcome Sanger Institute, Wellcome Genome Campus, Hinxton, UK) ,  Stabler R.A. (Department of Pathogen Molecular Biology, London School of Hygiene and Tropical Medicine, London, UK) ,  Crobach M.J.T. (National Reference Laboratory for CDI Surveillance, Department of Medical Microbiology and RIVM, Leiden University Medical Centre, Leiden, the Netherlands) ,  Corver J. (National Reference Laboratory for CDI Surveillance, Department of Medical Microbiology and RIVM, Leiden University Medical Centre, Leiden, the Netherlands) ,  Pituch H. (Department of Medical Microbiology, Medical University of Warsaw, Warsaw, Poland) ,  Ingebretsen A. (Department of Microbiology, Oslo University Hospital, Oslo, Norway) ,  Ingebretsen A. (Department of Infection Prevention, Oslo University Hospital, Oslo, Norway) ,  Pirmohamed M. (Department of Molecular and Clinical Pharmacology, The University of Liverpool, Liverpool, UK) ,  Faulds-Pain A. (Department of Pathogen Molecular Biology, London School of Hygiene and Tropical Medicine, London, UK) ,  Valiente E. (Department of Pathogen Molecular Biology, London School of Hygiene and Tropical Medicine, London, UK) ,  Lawley T.D. (Wellcome Sanger Institute, Wellcome Genome Campus, Hinxton, UK) ,  Fairweather N.F. (CMBI, Imperial College London, London, UK) ,  Kuijper E.J. (National Reference Laboratory for CDI Surveillance, Department of Medical Microbiology and RIVM, Leiden University Medical Centre, Leiden, the Netherlands) ,  Wren B.W. (Department of Pathogen Molecular Biology, London School of Hygiene and Tropical Medicine, London, UK)
資料名： Clinical Microbiology and Infection  (Clinical Microbiology and Infection)
巻： 26  号： 4  ページ： 492-498  発行年： 2020年 
JST資料番号： W3155A  ISSN： 1198-743X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Clostridium difficileは5つのクレードに分けられる主要な世界的ヒト病原体であり,そのクレード3は最も特性化されており,主にPCRリボタイプ(RT)023株から成る。著者らの目的はこのクレードを分析し,特性化することであった。本コホート研究において,C.difficile RT023感染症の臨床症状を,オランダ国家C.difficileサーベイランスプログラムからのデータを用いて,既知の「超毒性」および非高毒性株と比較して分析した。多様な起源のヨーロッパRT023株を収集し,全ゲノム配列を決定し,分離株間の遺伝的類似性を決定した。明確な特徴を調べ,特性化した。C.difficile RT023感染症の臨床症状は,クレード2(RT027)と5(RT078)(それぞれ35%,29%と27%の重度CDI)からの高毒性株で見られるものと,特にRT078と非高毒性株(RT0238%,他のRTs4%,p0.036)より著しい感染を示す。菌株CD305の完全ゲノム配列を,ロバストな参照として提示した。CD305の系統発生学的比較と多様な起源のヨーロッパのRT023株の以前に特性化されていない更なる79株は,系統間で>99.8%のペアワイズ同一性を有するわずかな遺伝的多様性を明らかにした。分析により,保存された病原性遺伝子座,二成分毒素及びファージ挿入毒素遺伝子型,S層蛋白質のグリコシル化,RT078の四遺伝子トレハロースクラスターの存在及びエスクナーゼ陰性遺伝子型を含むクレード3株の間の特徴的な特徴を明らかにした。最近の出現,病原性およびゲノム特性を考えると,クレード3株のサーベイランスはより高度に優先されるべきである。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 病原体 ,  ヒト ,  *Clostridium difficile ,  遺伝子 ,  キャラクタリゼーション ,  サーベイランス ,  ロバスト性 ,  ゲノム ,  感染症 ,  *病原性 ,  バクテリオファージ ,  遺伝子型 ,  *Clostridium ,  コホート研究 ,  グリコシル化

著者キーワード (7件)： Clostridium difficile ,  Clostridium difficile感染 ,  次世代シークエンシング ,  RT023 ,  トレハロース ,  S層 ,  クレード3

分類 (5件)： 微生物感染の生理と病原性  (EG03053T) ,  微生物の生化学  (EG03020N) ,  微生物検査法  (EG02020G) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  細菌による動物の伝染病  (FE02023A)

タイトルに関連する用語 (3件)： 病原性 ,  Clostridium ,  クレード