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J-GLOBAL ID：202002256855968424   整理番号：20A0975539

ゲノムワイドDNAメチル化分析により明らかにされた結腸直腸癌患者における腫瘍反応性CD8+T細胞の異なるエピジェネティックな特徴【JST・京大機械翻訳】

Distinct epigenetic features of tumor-reactive CD8+ T cells in colorectal cancer patients revealed by genome-wide DNA methylation analysis

著者 (19件)： Yang Rui (BIOPIC, Beijing Advanced Innovation Center for Genomics, and School of Life Sciences, Peking University, Beijing, China) ,  Cheng Sijin (BIOPIC, Beijing Advanced Innovation Center for Genomics, and School of Life Sciences, Peking University, Beijing, China) ,  Luo Nan (Department of Surgery, Beijing Shijitan Hospital, Capital Medical University, Beijing, China) ,  Luo Nan (Department of Surgery, Peking University Ninth School of Clinical Medicine, Beijing, China) ,  Gao Ranran (BIOPIC, Beijing Advanced Innovation Center for Genomics, and School of Life Sciences, Peking University, Beijing, China) ,  Yu Kezhuo (Peking-Tsinghua Center for Life Sciences, Academy for Advanced Interdisciplinary Studies, Peking University, Beijing, China) ,  Kang Boxi (BIOPIC, Beijing Advanced Innovation Center for Genomics, and School of Life Sciences, Peking University, Beijing, China) ,  Wang Li (BIOPIC, Beijing Advanced Innovation Center for Genomics, and School of Life Sciences, Peking University, Beijing, China) ,  Zhang Qiming (BIOPIC, Beijing Advanced Innovation Center for Genomics, and School of Life Sciences, Peking University, Beijing, China) ,  Fang Qiao (Peking-Tsinghua Center for Life Sciences, Academy for Advanced Interdisciplinary Studies, Peking University, Beijing, China) ,  Zhang Lei (Peking-Tsinghua Center for Life Sciences, Academy for Advanced Interdisciplinary Studies, Peking University, Beijing, China) ,  Li Chen (Institute of Molecular Medicine, Peking-Tsinghua Center for Life Sciences, Beijing Key Laboratory of Cardiometabolic Molecular Medicine, Peking University, Beijing, China) ,  He Aibin (Institute of Molecular Medicine, Peking-Tsinghua Center for Life Sciences, Beijing Key Laboratory of Cardiometabolic Molecular Medicine, Peking University, Beijing, China) ,  Hu Xueda (BIOPIC, Beijing Advanced Innovation Center for Genomics, and School of Life Sciences, Peking University, Beijing, China) ,  Peng Jirun (Department of Surgery, Beijing Shijitan Hospital, Capital Medical University, Beijing, China) ,  Peng Jirun (Department of Surgery, Peking University Ninth School of Clinical Medicine, Beijing, China) ,  Ren Xianwen (BIOPIC, Beijing Advanced Innovation Center for Genomics, and School of Life Sciences, Peking University, Beijing, China) ,  Zhang Zemin (BIOPIC, Beijing Advanced Innovation Center for Genomics, and School of Life Sciences, Peking University, Beijing, China) ,  Zhang Zemin (Peking-Tsinghua Center for Life Sciences, Academy for Advanced Interdisciplinary Studies, Peking University, Beijing, China)
資料名： Genome Biology (Web)  (Genome Biology (Web))
巻： 21  号： 1  ページ： 1-13  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7384A  ISSN： 1474-760X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 腫瘍反応性CD8+腫瘍浸潤リンパ球(TILs)は,腫瘍を特異的に認識し,破壊することができるT細胞のサブタイプを代表する。腫瘍反応性CD8+T細胞の調節機構を理解することは,重要な治療的意味を有する。しかし,このT細胞サブタイプのDNAメチル化状態は解明されていない。本研究では,結腸直腸癌患者からの対照として,腫瘍反応性およびbystander CD8+TILsならびにナイーブおよびエフェクター記憶CD8+T細胞サブタイプを分離し,それらのトランスクリプトームおよびメチローム特性を比較した。トランスクリプトームプロファイリングは,腫瘍反応性TILsが消耗した組織に居住する記憶特徴を有するという以前の結論を確認する。全ゲノムメチル化プロファイリングは,腫瘍反応性CD8+T細胞の異なるメチロームパターンを同定し,腫瘍反応性マーカーCD39とCD103は特異的に脱メチル化された。さらに,ナイーブT細胞の腫瘍反応性CD8+T細胞への移行時に動的変化が観察された。転写因子結合モチーフ濃縮分析は,腫瘍反応性CD8+T細胞において潜在的に重要な調節的役割を果たす3つの枯渇関連遺伝子(NR4A1,BATF,およびEGR2)およびVDRを含むいくつかの免疫関連転写因子を同定する。著者らの研究は,腫瘍反応性およびバイスタンダーCD8+TILsの形成におけるDNAメチル化の関与を支持し,新規DNAメチル化マーカーおよび将来の治療の開発のための価値ある資源を提供する。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *メチル化 ,  遺伝子 ,  *腫瘍 ,  *ゲノム ,  脱メチル ,  *T細胞 ,  転写因子 ,  トランスクリプトーム ,  *エピジェネティクス
準シソーラス用語： *CD8陽性T細胞 ,  腫瘍浸潤リンパ球 ,  *DNAメチル化 ,  *CD8陽性細胞 ,  ナイーブT細胞 ,  *結腸直腸癌 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： 大腸癌 ,  腫瘍反応性T細胞 ,  ビスタンダ ,  トランスクリプトーム ,  メチローム ,  転写因子 ,  T細胞消耗

分類 (1件)： 腫よう免疫  (ED03040A)

引用文献 (58件)：

• Nature.; Bystander CD8(+) T cells are abundant and phenotypically distinct in human tumour infiltrates; Y Simoni, E Becht, M Fehlings, CY Loh, SL Koo, KWW Teng; 557; 7706; 2018; 575-579; 10.1038/s41586-018-0130-2; citation_id=CR1
• Nature Medicine; Low and variable tumor reactivity of the intratumoral TCR repertoire in human cancers; Wouter Scheper, Sander Kelderman, Lorenzo F. Fanchi, Carsten Linnemann, Gavin Bendle, Marije A. J. de Rooij, Christian Hirt, Riccardo Mezzadra, Maarten Slagter, Krijn Dijkstra, Roelof J. C. Kluin, Petur Snaebjornsson, Katy Milne, Brad H. Nelson, Henry Zijlmans, Gemma Kenter, Emile E. Voest, John B. A. G. Haanen, Ton N. Schumacher; 25; 1; 2018; 89-94; 10.1038/s41591-018-0266-5; citation_id=CR2
• Nat Commun; Co-expression of CD39 and CD103 identifies tumor-reactive CD8 T cells in human solid tumors; T Duhen, R Duhen, R Montler, J Moses, T Moudgil, NF Miranda; 9; 1; 2018; 2724; 10.1038/s41467-018-05072-0; citation_id=CR3
• Cell; Dysfunctional CD8 T Cells Form a Proliferative, Dynamically Regulated Compartment within Human Melanoma; Hanjie Li, Anne M. van der Leun, Ido Yofe, Yaniv Lubling, Dikla Gelbard-Solodkin, Alexander C.J. van Akkooi, Marlous van den Braber, Elisa A. Rozeman, John B.A.G. Haanen, Christian U. Blank, Hugo M. Horlings, Eyal David, Yael Baran, Akhiad Bercovich, Aviezer Lifshitz, Ton N. Schumacher, Amos Tanay, Ido Amit; 176; 4; 2019; 775-789.e18; 10.1016/j.cell.2018.11.043; citation_id=CR4
• J Immunol; Molecular signatures distinguish human central memory from effector memory CD8 T cell subsets; T Willinger, T Freeman, H Hasegawa, AJ McMichael, MF Callan; 175; 9; 2005; 5895-5903; 10.4049/jimmunol.175.9.5895; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (9件)： ゲノム ,  DNAメチル化 ,  分析 ,  結腸直腸癌 ,  患者 ,  腫瘍 ,  反応性 ,  CD8+T細胞 ,  エピジェネティック