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J-GLOBAL ID:202002257020912937   整理番号:20A2732539

ゲノムスケールマッピングはYersinia pseudotuberculosisにおけるRpoNの複合調節活性を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Genome-Scale Mapping Reveals Complex Regulatory Activities of RpoN in Yersinia pseudotuberculosis
著者 (7件):
資料名:
巻:号:ページ: Null  発行年: 2020年 
JST資料番号: W5748A  ISSN: 2379-5077  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
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σ54として知られる代替シグマ因子であるABSTRACT RpoNは,この調節因子に関連する遺伝子がアップレギュレートされるYersinia pseudotuberculosis感染の持続的段階に関与する。ここでは,表現型とゲノムアッセイを組み合わせて,この病原体における役割と機能に関する洞察を提供する。RpoNはマウスのY.pseudotuberculosis病原性に必須であり,in vitro機能分析はそれが生物膜形成と運動性を制御することを示した。次世代配列決定と組み合わせたクロマチン免疫沈降を用いたY.pseudotuberculosis RpoNのゲノムワイド関連マッピングは,センスおよびアンチセンス鎖の両方における103の遺伝子間および遺伝子内部位に位置するRpoN結合モチーフを同定した。rpoNの欠失は,鞭毛集合,走化性,およびクオラムセンシングに関与する蛋白質をコードする遺伝子のダウンレギュレーションを含む遺伝子発現に大きな影響を有した。また,他の調節因子の変化した発現による間接効果と共に,他のシグマ因子とのクロストークの明確な兆候があった。RpoNにより,約130の遺伝子またはオペロンが潜在的に活性化または抑制されている結合部位の位置による差次的遺伝子発現のマッチングを行った。選択した遺伝子間結合部位の変異誘発は,RpoN結合の正および負の調節効果の両方を確認した。遺伝子内感覚部位の対応する突然変異は,関連遺伝子発現にあまり影響しなかった。驚くべきことに,アンチセンス鎖上の遺伝子内部位変異は,対応するセンス鎖によって運ばれる遺伝子の発現を一般的に減少させた。IMPORTANCは,真正細菌に広く分布する代替シグマ因子RpoN(σ54)が,病原性を含む多数の機能に重要な遺伝子発現の制御に関与している。宿主環境に対する適切な応答は感染を確立するための細菌にとって重要であり,関与する調節機構は将来の治療法の開発にとって高い関心事である。腸病原体Y.pseudotuberculosisにおけるRpoNの機能についてはほとんど知られていない。このレギュレータは,マウスにおける感染の確立に重要であることが確かめられ,おそらく運動性と生物膜形成に対する要求を含む。RpoNレギュロンは,同定された結合部位の変異誘発で確認できる遺伝子発現に対する活性化および抑制効果の両方を含んでいた。これは,Y.pseudotuberculosisにおけるRpoNのその種類の最初の研究であり,DNAへのその結合の生産性およびサイレント効果の両方を含む遺伝子発現の複雑な調節を明らかにし,腸内細菌におけるRpoN調節に関する重要な情報を提供する。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (5件):
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遺伝子発現  ,  微生物感染の生理と病原性  ,  微生物生理一般  ,  微生物の生化学  ,  生物学的機能 
タイトルに関連する用語 (4件):
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