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J-GLOBAL ID：202002257101860965   整理番号：20A1320960

HRMおよび16S rRNA遺伝子配列決定は,氷蓄熱中のヨーロッパシーバスの培養可能微生物相を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

HRM and 16S rRNA gene sequencing reveal the cultivable microbiota of the European sea bass during ice storage

著者 (5件)： Syropoulou Faidra (Lab of Marketing and Technology of Aquatic Products and Foods, Department of Ichthyology and Aquatic Environment, School of Agricultural Sciences, University of Thessaly, Fytokou street, 38446 Volos, Greece) ,  Parlapani Foteini F. (Lab of Marketing and Technology of Aquatic Products and Foods, Department of Ichthyology and Aquatic Environment, School of Agricultural Sciences, University of Thessaly, Fytokou street, 38446 Volos, Greece) ,  Bosmali Irene (Institute of Applied Biosciences, Centre for Research and Technology Hellas (CERTH), 57001 Thessaloniki, Greece) ,  Madesis Panagiotis (Institute of Applied Biosciences, Centre for Research and Technology Hellas (CERTH), 57001 Thessaloniki, Greece) ,  Boziaris Ioannis S. (Lab of Marketing and Technology of Aquatic Products and Foods, Department of Ichthyology and Aquatic Environment, School of Agricultural Sciences, University of Thessaly, Fytokou street, 38446 Volos, Greece)
資料名： International Journal of Food Microbiology  (International Journal of Food Microbiology)
巻： 327  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： A0434C  ISSN： 0168-1605  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 地中海養殖の最も重要な市販魚種である氷貯蔵ヨーロッパスズキ(Dicentrarchus labrax)の全培養可能な微生物叢を16S rRNA遺伝子配列分析を用いて決定した。高分解能融解(HRM)曲線プロファイルと配列分析(16S rRNA遺伝子のV3-V4領域)を,6つの時間間隔(日0,4,8,12,14と16)から採集した分離株の分化と同定のためにそれぞれ用い,一方,魚を氷に保存した。HRM分析は,10群(208分離株)の未知の微生物叢とHRM曲線プロファイルに基づく2つの単一分離株を識別した。各グループ内で>91%のHRMプロファイルを有する分離株は,配列決定分析を用いて同じ種に属することが分かった。したがって,10のグループはPsychrobacter glacincola,Ps.alimentarius,Ps.cryohalolentis,Ps.maritimus,Ps.fozii,Pseudomonas sp.,Paeniglutamicibacter sp.,Carnobacterium sp.,Leucobacter 乾燥icolisおよびBacillus thuringiensisの代表から成る。このアプローチに基づき,Ps.cryohalolentisは,他の種と比較して,魚類シェルフライフの始めに,最も優勢な系統型であることが分かった。この細菌の量は貯蔵を通して減少し,一方,Ps.glacincolaは増加し,官能最小受容性(日14)と拒絶(日16日)の時間において優勢であった。結論として,HRMは,魚類の微生物品質または安全性に関連した急速に利害関係者の問題を解決するための科学者のために,参照細菌菌株として各グループの代表を用いて,シーバス微生物叢の迅速定量に使用できる。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *微生物 ,  細菌 ,  *rRNA ,  *遺伝子 ,  養殖 ,  *ミクロフローラ ,  迅速分析 ,  Bacillus thuringiensis ,  高分解能
準シソーラス用語： Psychrobacter ,  *16S rRNA ,  配列解析 ,  *Dicentrarchus labrax ,  *遺伝子配列 ,  分離株 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： 魚類 ,  シーバス ,  水産養殖 ,  HRM ,  SSO ,  Microbiota ,  腐敗

分類 (3件)： 動物性水産食品  (FJ13020C) ,  微生物検査法  (EG02020G) ,  食品の汚染  (FJ01053P)

タイトルに関連する用語 (7件)： HRM ,  rRNA ,  遺伝子配列決定 ,  氷蓄熱 ,  ヨーロッパシーバス ,  培養 ,  微生物相