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J-GLOBAL ID：202002257607322606   整理番号：20A0382191

ヒトレスピロウイルス3における血球凝集素-ノイラミニダーゼ(HN)遺伝子の分子進化【JST・京大機械翻訳】

Molecular evolution of the hemagglutinin-neuraminidase (HN) gene in human respirovirus 3

著者 (10件)： Aso Jumpei (Department of Respiratory Medicine, Kyorin University School of Medicine, Tokyo, Japan) ,  Kimura Hirokazu (Department of Health Science, Gunma Paz University Graduate School of Health Science, Gunma, Japan) ,  Kimura Hirokazu (Department of Microbiology, Yokohama City University School of Medicine, Kanagawa, Japan) ,  Ishii Haruyuki (Department of Respiratory Medicine, Kyorin University School of Medicine, Tokyo, Japan) ,  Saraya Takeshi (Department of Respiratory Medicine, Kyorin University School of Medicine, Tokyo, Japan) ,  Kurai Daisuke (Department of General Medicine, Division of Infectious Diseases, Kyorin University School of Medicine, Tokyo, Japan) ,  Nagasawa Koo (Department of Pediatrics, Chiba University Graduate School of Medicine, Chiba, Japan) ,  Matsushima Yuki (Division of Virology, Kawasaki City Institute for Public Health, Kanagawa, Japan) ,  Ryo Akihide (Department of Microbiology, Yokohama City University School of Medicine, Kanagawa, Japan) ,  Takizawa Hajime (Department of Respiratory Medicine, Kyorin University School of Medicine, Tokyo, Japan)
資料名： Virus Research  (Virus Research)
巻： 277  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： A0381D  ISSN： 0168-1702  CODEN： VIREDF  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ヒト呼吸器ウイルス3(HRV3)は,ヒトにおける急性呼吸器感染症の主要原因物質である。HRV3は,正確には知られていないが,再発感染として明らかにできる。本研究では,様々な国で検出/分離されたこのウイルスの主要な抗原をコードする血球凝集素-ノイラミニダーゼ(HN)遺伝子の詳細な分子進化解析を行った。HN蛋白質モデルへのマッピングにより,時間スケール進化,類似性,選択圧,系統動力学,及び立体配座エピトープ予測の解析を行った。この方法において,HRV3のHN遺伝子の共通祖先とウシ呼吸ウイルス3が1815周辺に分岐し,系統樹において多くの系統を形成すると推定した。HN遺伝子の進化率は1.1×10~3置換/部位/年であったが,これらの置換の大部分は同義であった。HN蛋白質において,いくつかの陽性および多くの陰性選択部位が予測された。遺伝子の系統力学的変動が観察され,これらは各系統で異なっていた。さらに,大部分の予測B細胞エピトープは中和関連マウスモノクローナル抗体結合部位に対応しなかった。立体配座エピトープと中和部位の間のリンクの欠如は,自然に起こるHRV3再感染を説明する可能性がある。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *分子進化 ,  *血球凝集素 ,  抗原 ,  *遺伝子 ,  中性化 ,  *ヒト ,  エピトープ ,  系統樹 ,  呼吸器 ,  類似性 ,  モノクローナル抗体 ,  *ノイラミニダーゼ ,  立体配座 ,  結合部位
準シソーラス用語： 急性呼吸器感染症 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 分子進化 ,  ヒトレスピロウイルス3 ,  血球凝集素-ノイラミニダーゼ(HN)遺伝子 ,  立体配座エピトープ ,  生物情報学的分析

分類 (2件)： ウイルスの生化学  (EG04030F) ,  ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y)

タイトルに関連する用語 (6件)： ヒト ,  レスピロウイルス ,  血球凝集素 ,  ノイラミニダーゼ ,  遺伝子 ,  分子進化