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J-GLOBAL ID：202002257921158502   整理番号：20A1894644

膵臓腺癌における予後免疫関連遺伝子の同定と予後ノモグラムの確立:バイオインフォマティクス研究【JST・京大機械翻訳】

Identification of Prognostic Immune-Related Genes in Pancreatic Adenocarcinoma and Establishment of a Prognostic Nomogram: A Bioinformatic Study

著者 (9件)： Wu Guolin (Department of Hepatobiliary Surgery, The First Affiliated Hospital of Guangxi Medical University, Nanning 530021, China) ,  Deng Zhenfeng (Department of Hepatobiliary Surgery, The First Affiliated Hospital of Guangxi Medical University, Nanning 530021, China) ,  Jin Zongrui (Department of Hepatobiliary Surgery, The First Affiliated Hospital of Guangxi Medical University, Nanning 530021, China) ,  Wang Jilong (Department of Hepatobiliary Surgery, The First Affiliated Hospital of Guangxi Medical University, Nanning 530021, China) ,  Xu Banghao (Department of Hepatobiliary Surgery, The First Affiliated Hospital of Guangxi Medical University, Nanning 530021, China) ,  Zeng Jingjing (Department of Pathology, The First Affiliated Hospital of Guangxi Medical University, Nanning 530021, China) ,  Peng Minhao (Department of Hepatobiliary Surgery, The First Affiliated Hospital of Guangxi Medical University, Nanning 530021, China) ,  Wen Zhang (Department of Hepatobiliary Surgery, The First Affiliated Hospital of Guangxi Medical University, Nanning 530021, China) ,  Guo Ya (Department of Hepatobiliary Surgery, The First Affiliated Hospital of Guangxi Medical University, Nanning 530021, China)
資料名： BioMed Research International (Web)  (BioMed Research International (Web))
巻： 2020  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7008A  ISSN： 2314-6133  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景.すい腺癌(PAAD)の予後は極めて不良であり,改善されていない。したがって,患者の予後を評価する有効な方法は,それらの生存率を改善するために確立されなければならない。方法.本研究では,PAADの潜在的治療標的として使用できる免疫関連遺伝子を調べた。PAADコホートと関連臨床情報からのレベル3遺伝子発現データを,癌ゲノムアトラス(TCGA)データベースから得た。検証のために,他のPAADデータセット(DSE6452)を,遺伝子発現Omnibus(GEO)データベースからダウンロードした。TCGAとGEOからのPAADデータセットを用いて,遺伝子セット濃縮分析を用いて分子シグネチャデータベースを通して免疫関連遺伝子をスクリーニングした。次に,2つのデータセットの重複免疫関連遺伝子を同定した。免疫関連遺伝子の共発現ネットワークを構築した。【結果】3つの免疫関連遺伝子(CKLF,ERAP2,およびEREG)の徴候を,PAAD患者で同定した。署名は,それらの中央値リスクスコアに基づいて,PAAD患者を高リスク群と低リスク群に分けるのに使用できる。多変量Cox回帰分析を行い,PAADの独立予後因子を決定した。時間依存受信者動作特性(ROC)曲線分析を行い,予後シグネチャの予測精度を評価した。最後に,ノモグラムを,TCGA PAADデータセットの臨床的特徴とリスクスコアに基づく個別化予後予測モデルを評価するために確立した。機能評価と主成分分析により,予後シグネチャの精度をさらに評価した。結論.結果は,3つの免疫関連遺伝子のシグネチャがPAADのための優れた予測値を有することを示した。これらの知見は,個別化治療と医療決定の改善を助けるかもしれない。Copyright 2020 Guolin Wu et al. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ノモグラム ,  回帰分析 ,  データベース ,  ネットワーク ,  *遺伝子 ,  生存率 ,  *予後 ,  母集団 ,  主成分分析 ,  遺伝子発現 ,  個別化医療
準シソーラス用語： *バイオインフォマティクス ,  予測精度 ,  予後予測 ,  共発現 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  腫ようの診断  (GE03020J)

引用文献 (54件)：

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• L. Rahib, B. D. Smith, R. Aizenberg, A. B. Rosenzweig, J. M. Fleshman, L. M. Matrisian, "Projecting cancer incidence and deaths to 2030: the unexpected burden of thyroid, liver, and pancreas cancers in the United States," Cancer Research, vol. 74, no. 11, pp. 2913-2921, 2014.
• T. Kamisawa, L. D. Wood, T. Itoi, K. Takaori, "Pancreatic cancer," The Lancet, vol. 388, no. 10039, pp. 73-85, 2016.

タイトルに関連する用語 (8件)： 膵臓腺癌 ,  予後 ,  免疫 ,  遺伝子 ,  同定 ,  ノモグラム ,  バイオインフォマティクス ,  研究