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J-GLOBAL ID：202002258174777650   整理番号：20A1139736

部分最小二乗法を用いた遺伝子-薬物共モジュール同定【JST・京大機械翻訳】

Identify Gene-Drug Co-Modules by Partial Least Square Method

著者 (3件)： Mao Yujie (燕山大学 理学院,河北 秦皇島,066004) ,  Wei Dong (燕山大学 理学院,河北 秦皇島 066004;河北数港科技有限公司,河北 秦皇島 066004) ,  Li Yushuang (燕山大学 理学院,河北 秦皇島,066004)
資料名： Huaqiao Daxue Xuebao (Ziran Kexue Ban)  (Huaqiao Daxue Xuebao (Ziran Kexue Ban))
巻： 41  号： 1  ページ： 121-125  発行年： 2020年 
JST資料番号： C3297A  ISSN： 1000-5013  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： まず、薬物の二次元化学構造を数値配列に変換し、薬物間のピアソン相関係数を計算し、さらに薬物関連ネットワークを構築した。次に,遺伝子ネットワーク制約つきスパース部分最小二乗アルゴリズムに基づいて,薬物関連ネットワーク情報に加え,遺伝子と薬物関連ネットワーク正則制約を伴うスパース部分最小二乗(SGDPLS)アルゴリズムを提案した。最後に,SGDPLSアルゴリズムを遺伝子-薬物共モジュール認識に適用した。結果により、薬物関連ネットワーク情報の添加は、識別されたコモンモジュールにおける遺伝子モジュールと薬物モジュールの相関性を効果的に向上させ、コモンモジュールの生物解釈性を高めることができることが明らかになった。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アルゴリズム ,  ネットワーク ,  *遺伝子 ,  二次元 ,  部分最小二乗法
準シソーラス用語： 化学構造 ,  遺伝子ネットワーク ,  Pearson相関係数 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  薬物学一般  (GV01010J)

タイトルに関連する用語 (5件)： 部分最小二乗法 ,  遺伝子 ,  薬物 ,  モジュール ,  同定