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J-GLOBAL ID：202002258182121593   整理番号：20A0877759

Micmicro hydrocarbonydansから得たヒドラジド輸送体の基質結合蛋白質(SBP)による基質認識の構造的基礎【JST・京大機械翻訳】

Structural basis of substrate recognition by the substrate binding protein (SBP) of a hydrazide transporter, obtained from Microbacterium hydrocarbonoxydans

著者 (7件)： Shimamura Kaho (Department of Bioscience, Tokyo University of Agriculture, Setagaya-ku, Tokyo, Japan) ,  Akiyama Tomonori (Department of Bioscience, Tokyo University of Agriculture, Setagaya-ku, Tokyo, Japan) ,  Yokoyama Kazuhiro (Department of Bioscience, Tokyo University of Agriculture, Setagaya-ku, Tokyo, Japan) ,  Takenoya Mihoko (Department of Bioscience, Tokyo University of Agriculture, Setagaya-ku, Tokyo, Japan) ,  Ito Shinsaku (Department of Bioscience, Tokyo University of Agriculture, Setagaya-ku, Tokyo, Japan) ,  Sasaki Yasuyuki (Department of Bioscience, Tokyo University of Agriculture, Setagaya-ku, Tokyo, Japan) ,  Yajima Shunsuke (Department of Bioscience, Tokyo University of Agriculture, Setagaya-ku, Tokyo, Japan)
資料名： Biochemical and Biophysical Research Communications  (Biochemical and Biophysical Research Communications)
巻： 525  号： 3  ページ： 720-725  発行年： 2020年 
JST資料番号： B0118A  ISSN： 0006-291X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 唯一の炭素源としてヒドラジド化合物を用いて,Microbacterium hydrocarbonoxydansを単離した。これらの化合物を代謝する重要な酵素はヒドラニダーゼと同定され,酵素をコードする遺伝子を含むオペロンはゲノム配列決定により明らかにされた。また,オペロンはATP結合カセット輸送体(ABC輸送体)をコードする遺伝子を含み,これはヒドラジド化合物を輸送することが期待された。輸送体の成分サブユニットである基質結合蛋白質(SBP)は輸送のための正しい基質の認識において重要な役割を果たす。したがって,非天然ヒドラジド化合物の認識機構を解明するために,著者らは,それぞれ2.2Åおよび1.75Å分解能で,ヒドラジド化合物の有無にかかわらず,M.hydrocarbonoxydans(Mh-SBP)から得られたSBPの結晶構造を決定した。Mh-SBPの全体構造は,OppAのようなオリゴペプチド輸送体におけるSBPのそれらと類似していた。比較すると,Mh-SBPの配位及び非配位構造は開放型立体配座変化を示した。興味あることに,Mh-SBPに対する化合物の結合様式は,ヒドラジダーゼに対する化合物の結合様式とほとんど同じであり,ABC輸送体がこれらの化合物を輸送することを示唆した。さらに,ヒドラジド複合体構造に基づいて,蛋白質の他の推定基質,パラベンをMh-SBPと共に用いて,パラベン複合体構造を得た。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ヒドラジド ,  分解能 ,  ABC輸送体 ,  酵素 ,  配座転移 ,  *タンパク質 ,  遺伝子 ,  開放型 ,  オペロン ,  *基質 ,  サブユニット ,  オリゴペプチド ,  結晶構造 ,  複合体
準シソーラス用語： 炭素源 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： ABCトランスポーター ,  立体配座変化 ,  配位子特異性 ,  X線結晶構造

分類 (2件)： 微生物の生化学  (EG03020N) ,  分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (6件)： ヒドラジド ,  輸送体 ,  基質 ,  結合蛋白質 ,  基質認識 ,  基礎