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J-GLOBAL ID：202002258204972827   整理番号：20A1008602

反復性薬物治療癌細胞における広範な遺伝子調節不全の機構としてのスーパーエンハンサー再分布【JST・京大機械翻訳】

Super-Enhancer Redistribution as a Mechanism of Broad Gene Dysregulation in Repeatedly Drug-Treated Cancer Cells

著者 (13件)： Ma Qi (Department of Medicine, School of Medicine, University of California, San Diego, La Jolla, CA 92093, USA) ,  Yang Feng (Department of Medicine, School of Medicine, University of California, San Diego, La Jolla, CA 92093, USA) ,  Mackintosh Carlos (Department of Medicine, School of Medicine, University of California, San Diego, La Jolla, CA 92093, USA) ,  Jayani Ranveer Singh (Department of Medicine, School of Medicine, University of California, San Diego, La Jolla, CA 92093, USA) ,  Oh Soohwan (Department of Medicine, School of Medicine, University of California, San Diego, La Jolla, CA 92093, USA) ,  Jin Chunyu (Department of Medicine, School of Medicine, University of California, San Diego, La Jolla, CA 92093, USA) ,  Nair Sreejith Janardhanan (Department of Medicine, School of Medicine, University of California, San Diego, La Jolla, CA 92093, USA) ,  Merkurjev Daria (Department of Medicine, School of Medicine, University of California, San Diego, La Jolla, CA 92093, USA) ,  Ma Wubin (Department of Medicine, School of Medicine, University of California, San Diego, La Jolla, CA 92093, USA) ,  Allen Stephanie (Department of Medicine, School of Medicine, University of California, San Diego, La Jolla, CA 92093, USA) ,  Wang Dong (School of Basic Medical Sciences, Chengdu University of Traditional Chinese Medicine, Chengdu, Sichuan 611137, China) ,  Almenar-Queralt Angels (Department of Cellular and Molecular Medicine, University of California, San Diego, La Jolla, CA 92093, USA) ,  Garcia-Bassets Ivan (Department of Medicine, School of Medicine, University of California, San Diego, La Jolla, CA 92093, USA)
資料名： Cell Reports  (Cell Reports)
巻： 31  号： 3  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： W3124A  ISSN： 2211-1247  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： シスプラチンは,生命を脅かす効果を避けるために,準最適および間欠投与量で投与される抗腫瘍薬である。このレジメンは短期間で症状を短く改善するが,長期に悪性疾患に至る。クロマチンから翻訳統合クロマチン免疫沈降配列決定(ChIP-seq),全体的ラン-オン配列決定(GRO-seq),RNA配列決定(RNA-seq),およびリボソームプロファイリングにより,シスプラチン曝露の良く確立された卵巣癌モデルを用いて,シスプラチンが悪性の特徴をどのように理解するかについて述べた。このアプローチにより,ヒトトランスクリプトームを異なる調節原理を表す遺伝子モジュールに分離することが可能になり,ほとんどのシスプラチン破壊モジュールがスーパーエンハンサー可塑性の基礎となるイベントと関連することを特性化することができる。これらのイベントは,癌細胞が薬物刺激死のプログラムを最終的に終了することなく開始するときに発生する。Page Rankに基づくアルゴリズムを用いて,この可塑性の駆動因子としてスーパーエンハンサーレギュレータISL1を予測し,CRISPR/dCas9-KRAB阻害(CRISPRi)とCRISPR/dCas9-VP64活性化(CRISPRa)ツールを用いてこの予測を検証した。これらを合わせて,シスプラチンは,死に近い経験を生じるように誘導するとき,癌細胞を再プログラムすることを提案する。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アルゴリズム ,  塑性 ,  RNA【核酸】 ,  *遺伝子 ,  クロマチン ,  死 ,  *腫瘍細胞 ,  ヒト ,  *薬物療法 ,  *遺伝的調節 ,  リボソーム ,  悪性疾患 ,  シスプラチン ,  卵巣腫瘍 ,  トランスクリプトーム

著者キーワード (10件)： マルチオーミックアプローチ ,  遺伝子調節不全 ,  スーパーエンハンサー ,  シスプラチン ,  薬剤耐性 ,  卵巣癌 ,  Gro-Seq ,  リボソームプロファイリング ,  SEURAT ,  Pagerank

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (5件)： 薬物治療 ,  癌細胞 ,  遺伝子調節 ,  スーパーエンハンサー ,  再分布