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文献
J-GLOBAL ID:202002258235293324   整理番号:20A0877817

C末端40アミノ酸を欠く大腸菌UvrDのDNA巻き戻し動力学【JST・京大機械翻訳】

DNA-Unwinding Dynamics of Escherichia coli UvrD Lacking the C-Terminal 40 Amino Acids
著者 (1件):
資料名:
巻: 118  号:ページ: 1634-1648  発行年: 2020年 
JST資料番号: B0298A  ISSN: 0006-3495  CODEN: BIOJAU  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: オランダ (NLD)  言語: 英語 (EN)
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大腸菌UvrD蛋白質は,スーパーファミリーIに属する非六量体DNAヘリカーゼであり,ヌクレオチド除去修復とメチル指向ミスマッチ修復の両方において重要な役割を果たす。以前のデータは,野生型UvrDがそのオリゴマー型において最適活性を有することを示唆した。しかしながら,UvrD-DNA複合体の結晶構造は,C末端40アミノ酸(UvrDΔ40C)を欠くUvrD変異体を用いて単量体UvrDに対してのみ分解された。しかしながら,UvrDΔ40Cを用いて行った生化学的知見は,この変異体が野生型UvrDのそれに匹敵するが,この変異体は二量化できないことを示した。C末端はヘリカーゼ及び二量体化活性を有する多くの蛋白質に対する核酸結合において必須の役割を果たすが,C末端の正確な機能はほとんど理解されていない。従って,UvrDのC末端アミノ酸の機能を理解するために,単一分子直接可視化を行った。染料標識UvrDΔ40C分子の光退色は,2つまたは3つのUvrDΔ40C分子がATP不在下で20ヌクレオチド,3′一本鎖DNA尾部を持つ18bp二本鎖DNAと同時に結合できることを明らかにした。ATP存在下での突然変異体のDNA及びDNA巻き戻し動力学との変異体の会合/解離の同時可視化により,野生型UvrDと同様に,2つ又は3つのUvrDΔ40C分子が主にDNA巻き戻しの原因であることを示した。第二結合単量体に対する決定された会合/解離速度定数は野生型UvrDのそれより~2.5倍大きかった。DNA巻き戻しにおける複数のUvrDΔ40C分子の関与も生理食塩濃度(200mM NaCl)下で観察された。これらの結果は,オリゴマーを形成する複数のUvrDΔ40C分子がin vivoでDNA巻き戻しにおいて活性な役割を果たし,C末端40残基を削除することが第一結合UvrD単量体との相互作用に影響せずにDNAと第二UvrD単量体の相互作用を変化させることを示唆した。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (1件):
分類
JSTが定めた文献の分類名称とコードです
分子遺伝学一般 

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