トルコからのHyphantria cunea granulovirus(HYCUGV-HC1)のゲノム配列分析と組織化【JST・京大機械翻訳】

Gencer Donus; Bayramoglu Zeynep; Nalcacioglu Remziye; Demirbag Zihni; Demir Ismail

文献

J-GLOBAL ID：202002258533835460 整理番号：20A0277022

トルコからのHyphantria cunea granulovirus(HYCUGV-HC1)のゲノム配列分析と組織化【JST・京大機械翻訳】

Genome sequence analysis and organization of the Hyphantria cunea granulovirus (HycuGV-Hc1) from Turkey

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資料名：
巻： 112 号： 1 ページ： 459-466 発行年： 2020年
JST資料番号： T0422A ISSN： 0888-7543 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：オランダ (NLD) 言語：英語 (EN)

秋のウェブワーム(Hyphantria cunea)は,広範囲の作物と栽培された広葉植物種に影響を及ぼす。害虫は北米に固有であり,ヨーロッパに導入され,中央アジアとしてさらに広がっている。その分布を制御するためのいくつかの試みにもかかわらず,害虫は世界中で損傷を引き起こすことを続けている。トルコにおけるH.cuneaの幼生から分離された自然発生バキュロウイルス,Hyphantriacunea肉芽腫(HycuGV-Hc1)は,この害虫に対する微生物防除剤としての可能性を持つと思われる。本報告では,幼生期に影響を及ぼし,それを他のバキュロウイルスゲノムと比較するか粒状分離株(HycuGV-Hc1)の完全なゲノム配列と組織化について述べる。HycuGV-Hc1ゲノムは,39.3%G+Cのヌクレオチド分布を持つ114,825bpの円形二本鎖DNAである。バイオインフォマティクス解析は,(ORF)≧150ヌクレオチドの132の推定オープンリーディングフレームを予測した。未知の機能を有する24のORFがある。7つの相同反復領域(時間)と2つのbro遺伝子(bro-1とbro-2)をゲノムにおいて同定した。他のバキュロウイルスゲノムと比較して,HycuGV-Hc1は遺伝子含有量と組織化においていくつかの差異を明らかにした。遺伝子パリティプロットと系統発生学は,HycuGV-Hc1がBetabaculovirusであり,Plutella xylostella肉芽腫に密接に関連していることを確認した。本研究は,HycuGV分離株の遺伝的変異に関する著者らの知識を拡大し,肉芽腫ウイルスの性質に関するさらなる新しい知識を提供する。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子の構造と化学

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